61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1094 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37710  peptidase E  44.5 
 
 		 212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  38.41 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  34.86 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  29.27 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  28.43 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  29.55 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  25.29 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0972  peptidase E  29.29 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  31.02 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  32.09 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  44.71 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  29.17 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  28.74 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  32.19 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  27.92 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  30 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  32.17 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  29.53 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  34.34 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  28.48 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  32.17 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  20.69 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  30.43 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  32.17 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  33.04 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  30.43 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  41.82 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  30.43 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  26.62 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  25.86 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1676  peptidase S51 dipeptidase E  25.74 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  32.88 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  25.49 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  29.57 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1788  hypothetical protein  23.32 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  38.6 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  38.6 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  38.6 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  30.89 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  38.6 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  27.1 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  38.6 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  38.6 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  38.6 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  38.6 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  38.6 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  32.97 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  37.5 
 
 		 247 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  38.6 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  38.6 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  38.6 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1000  hypothetical protein  28.39 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0358258  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  30.6 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  38.6 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  38.89 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  28.09 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10751  peptidase E  26.45 
 
 		 226 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.293161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2070  peptidase S51, dipeptidase E  24.67 
 
 		 259 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  22.28 
 
 		 232 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3556  hypothetical protein  22.8 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.230544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>