54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37710  peptidase E  100 
 
 		 212 aa  403  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  44.5 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  41.3 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  31.53 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  28.43 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  33.5 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  30.18 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  27.78 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  37.91 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3247  peptidase S51 dipeptidase E  33.86 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453471  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  30.47 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0972  peptidase E  30.67 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  31.11 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1935  peptidase S51 dipeptidase E  32.82 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000428456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  36.56 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  28.85 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2868  conserved hypothetical conserved fusion protein  30.05 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  31.62 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3280  peptidase E  36.78 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0167296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  34.88 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  35.29 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  34.51 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  35.79 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  38.37 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  35.48 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  34.51 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  37.63 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  35.48 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  34.69 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  35.48 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  28.12 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  35.23 
 
 		 232 aa  48.1  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  32.74 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  35.48 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  39.53 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  34.41 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  35.61 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  28.97 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  28.3 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  32.26 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37956  predicted protein  29.23 
 
 		 382 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.834363  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  28.06 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  32.32 
 
 		 222 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  32.94 
 
 		 251 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  32.89 
 
 		 235 aa  41.6  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>