31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1665 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1665  peptidase S51, dipeptidase E  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0948934  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  36.75 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  39.09 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  38.39 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  32.13 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2868  conserved hypothetical conserved fusion protein  29.67 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  32.53 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  38.82 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  38.82 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  38.82 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  38.82 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  37.65 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  37.65 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  37.65 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  37.65 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  37.65 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  37.65 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  37.65 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  37.65 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  37.65 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  25.74 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  33.33 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  30 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  28 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  27.45 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  32.18 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  29.67 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  28.4 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  34.12 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  31.52 
 
 		 323 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  22.63 
 
 		 204 aa  42  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>