41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02370  peptidase E  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18450  peptidase E  75.4 
 
 		 250 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17206  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0136  peptidase S51, dipeptidase E  59.76 
 
 		 247 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1620  peptidase S51 dipeptidase E  56.1 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511149  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3365  peptidase S51 dipeptidase E  54.84 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225018  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1273  peptidase S51 dipeptidase E  51.63 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3782  peptidase S51, dipeptidase E  53.57 
 
 		 243 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1776  peptidase S51 dipeptidase E  52.65 
 
 		 280 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125751  normal  0.183168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3283  peptidase S51 dipeptidase E  50.82 
 
 		 243 aa  231  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.413219  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3137  peptidase S51, dipeptidase E  50.62 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4161  peptidase S51 dipeptidase E  49.59 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3095  peptidase S51 dipeptidase E  45.93 
 
 		 245 aa  201  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2642  hypothetical protein  43.38 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1268  peptidase S51 dipeptidase E  46.15 
 
 		 248 aa  164  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  0.51146 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00740  peptidase E  44 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1676  peptidase S51 dipeptidase E  36.95 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0201  peptidase S51 dipeptidase E  40 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2070  peptidase S51, dipeptidase E  32.84 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10751  peptidase E  30.93 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.293161  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10721  peptidase E  29.53 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  30.89 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1000  hypothetical protein  28.64 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0358258  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1748  peptidase S51 dipeptidase E  39.49 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0200  peptidase S51 dipeptidase E  38.24 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0394  hypothetical protein  25.97 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10841  hypothetical protein  25.97 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103566  hitchhiker  0.00469942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02569  peptidase E  33.11 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  27.43 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1788  hypothetical protein  29.31 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  26.5 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1622  peptidase E  26.5 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1643  hypothetical protein  26.5 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  26.5 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  26.5 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1774  hypothetical protein  26.5 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1824  hypothetical protein  26.5 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  27.83 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3556  hypothetical protein  26.5 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.230544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  26.04 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37460  predicted protein  24.82 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  26.55 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>