39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3365 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3365  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 
244 aa  482  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3782  peptidase S51, dipeptidase E  67.08 
 
 
243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1776  peptidase S51 dipeptidase E  70.59 
 
 
280 aa  307  8e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125751  normal  0.183168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3137  peptidase S51, dipeptidase E  69.33 
 
 
254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638284  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3283  peptidase S51 dipeptidase E  60.82 
 
 
243 aa  271  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.413219  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4161  peptidase S51 dipeptidase E  65.84 
 
 
243 aa  271  8.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000119415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0136  peptidase S51, dipeptidase E  58.47 
 
 
247 aa  262  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1620  peptidase S51 dipeptidase E  59.02 
 
 
243 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511149  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3095  peptidase S51 dipeptidase E  58.37 
 
 
245 aa  255  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02370  peptidase E  54.84 
 
 
247 aa  249  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.946739  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1273  peptidase S51 dipeptidase E  55.56 
 
 
241 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2642  hypothetical protein  58.57 
 
 
245 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100609  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18450  peptidase E  52.02 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17206  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1268  peptidase S51 dipeptidase E  55.07 
 
 
248 aa  231  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  0.51146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0201  peptidase S51 dipeptidase E  44.5 
 
 
249 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1676  peptidase S51 dipeptidase E  42.13 
 
 
194 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00740  peptidase E  46.12 
 
 
240 aa  145  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2070  peptidase S51, dipeptidase E  37.25 
 
 
259 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0200  peptidase S51 dipeptidase E  44.13 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10721  peptidase E  30.37 
 
 
226 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0394  hypothetical protein  29.89 
 
 
230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10841  hypothetical protein  29.89 
 
 
230 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103566  hitchhiker  0.00469942 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10751  peptidase E  31.29 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.293161  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1000  hypothetical protein  27.18 
 
 
226 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0358258  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  35.71 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1748  peptidase S51 dipeptidase E  36.62 
 
 
201 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02569  peptidase E  32.5 
 
 
207 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  27.27 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  23.5 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  22.65 
 
 
232 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1774  hypothetical protein  22.65 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1643  hypothetical protein  22.65 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1622  peptidase E  22.65 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1824  hypothetical protein  22.65 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  23.76 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  22.65 
 
 
232 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1788  hypothetical protein  22.16 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3556  hypothetical protein  22.65 
 
 
232 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.230544  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  21.98 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>