40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1273 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1273  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 
241 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0136  peptidase S51, dipeptidase E  62.6 
 
 
247 aa  296  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1620  peptidase S51 dipeptidase E  66.39 
 
 
243 aa  291  7e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511149  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3283  peptidase S51 dipeptidase E  60.08 
 
 
243 aa  267  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.413219  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02370  peptidase E  51.63 
 
 
247 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.946739  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18450  peptidase E  52.44 
 
 
250 aa  239  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17206  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3365  peptidase S51 dipeptidase E  55.56 
 
 
244 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3782  peptidase S51, dipeptidase E  56.03 
 
 
243 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1776  peptidase S51 dipeptidase E  53.81 
 
 
280 aa  223  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125751  normal  0.183168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3095  peptidase S51 dipeptidase E  51.26 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3137  peptidase S51, dipeptidase E  51.25 
 
 
254 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638284  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4161  peptidase S51 dipeptidase E  53.68 
 
 
243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2642  hypothetical protein  47.3 
 
 
245 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100609  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1268  peptidase S51 dipeptidase E  47.6 
 
 
248 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  0.51146 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00740  peptidase E  48.04 
 
 
240 aa  149  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1676  peptidase S51 dipeptidase E  37.5 
 
 
194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0201  peptidase S51 dipeptidase E  37.9 
 
 
249 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0200  peptidase S51 dipeptidase E  43.52 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10751  peptidase E  30.86 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.293161  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10721  peptidase E  32.92 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  30.86 
 
 
226 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1000  hypothetical protein  31.68 
 
 
226 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0358258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2070  peptidase S51, dipeptidase E  30.8 
 
 
259 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0394  hypothetical protein  30.91 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10841  hypothetical protein  30.91 
 
 
230 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103566  hitchhiker  0.00469942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02569  peptidase E  33.78 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1748  peptidase S51 dipeptidase E  43.55 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  30.14 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  21.81 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1788  hypothetical protein  22.34 
 
 
232 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  21.81 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1643  hypothetical protein  21.81 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1824  hypothetical protein  21.81 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1774  hypothetical protein  21.81 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1622  peptidase E  21.81 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  21.81 
 
 
232 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  25.42 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3556  hypothetical protein  21.81 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.230544  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  23.68 
 
 
232 aa  52  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37460  predicted protein  28.67 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>