More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2062 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2062  ABC transporter related  100 
 
 
250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.698735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.1 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.13 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.4 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.47 
 
 
325 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.73 
 
 
324 aa  195  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.67 
 
 
327 aa  192  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 
266 aa  191  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.7 
 
 
326 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0722  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.93 
 
 
295 aa  191  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.528459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3238  ABC transporter related  40.51 
 
 
304 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.6 
 
 
328 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.89 
 
 
325 aa  188  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.22 
 
 
327 aa  188  8e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 
324 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.7 
 
 
328 aa  185  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  41.82 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.92 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.4 
 
 
323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.93 
 
 
329 aa  180  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.21 
 
 
319 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 
339 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 
338 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.7 
 
 
323 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.92 
 
 
333 aa  176  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  38.12 
 
 
317 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.4 
 
 
328 aa  174  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.85 
 
 
282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  44.19 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
330 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.52 
 
 
334 aa  171  9e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  40.35 
 
 
345 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  42.33 
 
 
302 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  37.25 
 
 
510 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.14 
 
 
321 aa  168  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  40.57 
 
 
305 aa  167  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.47 
 
 
325 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1418  ABC transporter related  40.85 
 
 
283 aa  167  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  40.09 
 
 
305 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.65 
 
 
333 aa  166  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.36 
 
 
308 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  39.46 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.32 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  39.11 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.64 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.52 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  37.72 
 
 
311 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  41.29 
 
 
300 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.27 
 
 
322 aa  163  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.57 
 
 
321 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  39.27 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.15 
 
 
343 aa  162  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  39.01 
 
 
339 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  39.52 
 
 
275 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  38.05 
 
 
320 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  39.27 
 
 
311 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.18 
 
 
338 aa  159  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  40.65 
 
 
308 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
308 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 
330 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.44 
 
 
334 aa  158  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4511  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 
380 aa  158  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1742  ABC transporter related  38.36 
 
 
314 aa  158  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000920436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
312 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1202  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.74 
 
 
315 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.0328977 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  33.47 
 
 
512 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  40.78 
 
 
293 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
315 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  36.9 
 
 
246 aa  156  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  34.94 
 
 
599 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  37.9 
 
 
310 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.34 
 
 
317 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  34.66 
 
 
593 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.14 
 
 
308 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.74 
 
 
320 aa  154  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  37.91 
 
 
319 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  37.44 
 
 
310 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  36.76 
 
 
330 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  38.89 
 
 
303 aa  153  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  36.55 
 
 
324 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  38.65 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  38.39 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  39.59 
 
 
340 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  37.44 
 
 
319 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  33.6 
 
 
576 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  39.34 
 
 
332 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  33.48 
 
 
594 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  36.4 
 
 
589 aa  151  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.58 
 
 
324 aa  151  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  33.33 
 
 
593 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2251  ABC transporter related protein  42.06 
 
 
266 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00759154  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  32.66 
 
 
580 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  35.42 
 
 
583 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  36.49 
 
 
279 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3673  ABC transporter related protein  40.97 
 
 
339 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  32.66 
 
 
580 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  34.58 
 
 
249 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4260  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.6 
 
 
317 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.330062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>