More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2031 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08201  peptidase, M16 family protein  42.86 
 
 
990 aa  828    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0390  M16 family peptidase  64.14 
 
 
976 aa  1315    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0303  M16 family peptidase  64.37 
 
 
983 aa  1318    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2031  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
985 aa  2021    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.79996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2368  peptidase M16 domain protein  65.2 
 
 
981 aa  1350    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3516  peptidase M16 domain protein  41.12 
 
 
977 aa  788    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0410  peptidase M16 domain protein  66.73 
 
 
979 aa  1376    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1230  zinc protease  44.39 
 
 
979 aa  825    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0913  peptidase M16 domain protein  41.82 
 
 
982 aa  799    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1829  peptidase M16 domain protein  70.67 
 
 
984 aa  1456    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.661414 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0141  peptidase M16 domain protein  42.69 
 
 
975 aa  825    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2025  peptidase M16 domain-containing protein  66.56 
 
 
981 aa  1338    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0310906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2263  peptidase M16 domain protein  34.68 
 
 
980 aa  629  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000614686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6480  peptidase M16 domain protein  35.69 
 
 
1014 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3629  peptidase M16 domain-containing protein  29.24 
 
 
497 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.854314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  28.25 
 
 
494 aa  196  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  28.13 
 
 
510 aa  196  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  29.82 
 
 
468 aa  194  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  29.23 
 
 
501 aa  194  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  27.85 
 
 
494 aa  192  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2530  peptidase M16-like  28.54 
 
 
496 aa  191  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0622  peptidase M16-like  28.88 
 
 
503 aa  183  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  27.63 
 
 
532 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1598  peptidase M16 domain-containing protein  28.92 
 
 
493 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  26.98 
 
 
550 aa  171  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  26.55 
 
 
518 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  26.53 
 
 
539 aa  168  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  25.31 
 
 
526 aa  152  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  26.1 
 
 
508 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  24.44 
 
 
526 aa  149  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  24.24 
 
 
520 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  26 
 
 
528 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  24.24 
 
 
494 aa  128  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  23.45 
 
 
477 aa  127  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  21.95 
 
 
947 aa  126  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  23.57 
 
 
453 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  25.17 
 
 
440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  24.36 
 
 
484 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  23.61 
 
 
499 aa  120  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  22.72 
 
 
470 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  20.91 
 
 
947 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  22.71 
 
 
506 aa  117  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  24.14 
 
 
452 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  20.08 
 
 
930 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  22.12 
 
 
470 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  21.53 
 
 
455 aa  115  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  23.92 
 
 
453 aa  115  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  22.05 
 
 
442 aa  114  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  21.2 
 
 
959 aa  114  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  22.05 
 
 
459 aa  113  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  20.29 
 
 
921 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  22.56 
 
 
945 aa  112  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  23.33 
 
 
493 aa  112  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  25.17 
 
 
422 aa  112  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  22.05 
 
 
504 aa  111  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  22.02 
 
 
912 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  21.79 
 
 
501 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  23.86 
 
 
489 aa  110  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  23.08 
 
 
466 aa  108  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  22.2 
 
 
484 aa  108  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  23.76 
 
 
492 aa  108  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  21.33 
 
 
454 aa  108  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  26.41 
 
 
441 aa  108  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  26.03 
 
 
457 aa  108  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  24.4 
 
 
461 aa  107  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  23.9 
 
 
477 aa  107  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  25.61 
 
 
428 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  22.03 
 
 
484 aa  106  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  25.97 
 
 
457 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  22.1 
 
 
530 aa  106  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  21.72 
 
 
944 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  20 
 
 
952 aa  105  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  23.45 
 
 
440 aa  105  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  23.91 
 
 
943 aa  104  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  22.35 
 
 
459 aa  104  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  21 
 
 
944 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  25.8 
 
 
950 aa  103  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  23.71 
 
 
489 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  23.4 
 
 
453 aa  103  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0907  peptidase M16 domain-containing protein  23.23 
 
 
472 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  21.15 
 
 
921 aa  102  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  20.59 
 
 
952 aa  102  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  23.47 
 
 
464 aa  102  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  23.62 
 
 
476 aa  102  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  24.28 
 
 
459 aa  101  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  23.51 
 
 
461 aa  101  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  21.26 
 
 
443 aa  101  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0941  peptidase M16 domain-containing protein  22.27 
 
 
472 aa  101  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  22.34 
 
 
464 aa  101  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  24.3 
 
 
463 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  23.85 
 
 
465 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  23.85 
 
 
465 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  25.78 
 
 
942 aa  100  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  23.49 
 
 
460 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  23.12 
 
 
974 aa  100  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  24.61 
 
 
439 aa  100  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  20.56 
 
 
959 aa  100  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  21.22 
 
 
949 aa  99  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  24.12 
 
 
464 aa  99  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  21.34 
 
 
949 aa  99  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>