More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1886 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1886  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  100 
 
 
379 aa  769    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1061  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  72.85 
 
 
383 aa  588  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.406887  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1498  Fis family transcriptional regulator  64.56 
 
 
395 aa  519  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1702  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  65.71 
 
 
386 aa  511  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0294499  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1331  Fis family transcriptional regulator  60.24 
 
 
415 aa  509  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.373385  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1593  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  64.12 
 
 
378 aa  499  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0843  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  62.6 
 
 
398 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2061  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.66 
 
 
442 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1822  transcriptional regulator  41.52 
 
 
423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2728  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.86 
 
 
431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0148  sigma-54-dependent transcriptional regulator  42.82 
 
 
417 aa  302  7.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1848  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.48 
 
 
419 aa  298  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0605  hypothetical protein  40.38 
 
 
426 aa  296  3e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1203  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.73 
 
 
417 aa  296  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.477797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0990  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.76 
 
 
460 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00695  transcriptional regulator  40.29 
 
 
420 aa  294  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195355  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0248  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  40.64 
 
 
411 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.82 
 
 
508 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5917  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.44 
 
 
419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000432262  normal  0.978022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2959  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.7 
 
 
513 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1461  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.59 
 
 
491 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.750458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2387  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.62 
 
 
510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2232  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.89 
 
 
509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0243568 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2274  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.83 
 
 
512 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1988  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.16 
 
 
509 aa  272  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0970  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.73 
 
 
459 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000694494  normal  0.524712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1435  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.71 
 
 
498 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2812  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.49 
 
 
466 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0789  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  55.27 
 
 
448 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0471  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.78 
 
 
349 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0982753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3335  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  53.5 
 
 
458 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4593  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.21 
 
 
665 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273908  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1510  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.9 
 
 
448 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2194  response regulator receiver domain-containing protein  54.94 
 
 
479 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0427  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  51.05 
 
 
458 aa  260  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0884  transcriptional regulator FleQ  51.12 
 
 
471 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0915  transcriptional regulator FleQ  55.17 
 
 
471 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0109  two component Fis family transcriptional regulator  51.67 
 
 
466 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.03 
 
 
454 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0769  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  53.16 
 
 
453 aa  259  7e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2149  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50.2 
 
 
477 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1994  two component signal transduction response regulator  41.27 
 
 
477 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2807  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.16 
 
 
466 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  54.24 
 
 
458 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0433  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.41 
 
 
472 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2079  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  52.99 
 
 
505 aa  257  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2959  Fis family transcriptional regulator  54.04 
 
 
341 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1017  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50.4 
 
 
445 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.246569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.61 
 
 
463 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2362  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  54.74 
 
 
479 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50.62 
 
 
451 aa  257  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  50.83 
 
 
495 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2087  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  45.33 
 
 
451 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1411  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  51.42 
 
 
664 aa  256  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1305  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  51.6 
 
 
379 aa  255  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.314792  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2494  response regulator receiver protein  51.6 
 
 
452 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1157  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  47.64 
 
 
502 aa  254  1.0000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3003  two component Fis family transcriptional regulator  51.25 
 
 
465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697126  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.02 
 
 
473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0187  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50.63 
 
 
457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0823  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.67 
 
 
456 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.449732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40 
 
 
494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2312  sigma 54 dependent transcription regulator  38.9 
 
 
493 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1324  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  54.89 
 
 
350 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2016  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.9 
 
 
493 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000590429 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1446  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.2 
 
 
366 aa  253  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396101  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1494  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  54.31 
 
 
491 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.959617 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2353  phosphocarrier HPr/sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  50 
 
 
668 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4373  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  54.31 
 
 
491 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3934  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  54.31 
 
 
491 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532257  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02227  sigma-54 interacting transcription regulator protein  55.46 
 
 
384 aa  252  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  39.5 
 
 
461 aa  252  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0776  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  50 
 
 
454 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002951  regulatory protein LuxO  36.83 
 
 
468 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2298  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.8 
 
 
452 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02959  hypothetical protein  37.63 
 
 
467 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1498  flagellar regulatory protein A  53.02 
 
 
509 aa  252  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.522741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1954  transcriptional regulator FleQ  53.88 
 
 
491 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145885  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2606  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.04 
 
 
501 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1926  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  50.39 
 
 
575 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002811  flagellar regulatory protein FleQ  40.37 
 
 
488 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.42 
 
 
467 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000637809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0570  NifA subfamily transcriptional regulator  50.83 
 
 
508 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.106051  normal  0.50757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3226  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  49.58 
 
 
335 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1639  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  38.71 
 
 
473 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2001  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  54.7 
 
 
482 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.24 
 
 
473 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  39.5 
 
 
461 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3461  helix-turn-helix, Fis-type  53.88 
 
 
491 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.24 
 
 
473 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0911  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  50 
 
 
456 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  50 
 
 
456 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.523432  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3878  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.88 
 
 
468 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.330744  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3356  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.9 
 
 
484 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3767  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.88 
 
 
468 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114638  normal  0.0523944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4024  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.42 
 
 
467 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42797e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3765  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.2 
 
 
463 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000821276  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.17 
 
 
470 aa  250  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1532  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.88 
 
 
491 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497768  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1228  Fis family transcriptional regulator  48.51 
 
 
549 aa  250  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>