More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1573 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1573  peptidase M50  100 
 
 
252 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1230  peptidase M50  81.75 
 
 
252 aa  418  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.704176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0005  peptidase M50  61.04 
 
 
250 aa  317  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  33.33 
 
 
373 aa  99  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  38.58 
 
 
367 aa  98.6  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  44.55 
 
 
343 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.22 
 
 
374 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  37.3 
 
 
375 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.72 
 
 
357 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  35.71 
 
 
377 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.37 
 
 
383 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.5 
 
 
383 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.88 
 
 
335 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.88 
 
 
335 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40 
 
 
392 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.24 
 
 
424 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  35.92 
 
 
450 aa  90.1  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  28.51 
 
 
337 aa  90.1  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  40.5 
 
 
383 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0991  peptidase M50  30.24 
 
 
268 aa  89.4  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.43 
 
 
385 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  45.54 
 
 
450 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  45.54 
 
 
475 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  39.57 
 
 
448 aa  88.2  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  37.21 
 
 
386 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.71 
 
 
361 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  40.62 
 
 
469 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  40.17 
 
 
383 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  40 
 
 
386 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  43.4 
 
 
336 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.5 
 
 
455 aa  86.3  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.21 
 
 
450 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0246  membrane-associated Zn-dependent protease 1  37.1 
 
 
420 aa  86.3  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  46.79 
 
 
348 aa  85.9  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.56 
 
 
463 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.56 
 
 
463 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.68 
 
 
454 aa  85.5  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.56 
 
 
463 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.56 
 
 
463 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.19 
 
 
383 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.56 
 
 
463 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  41.74 
 
 
347 aa  85.5  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.56 
 
 
463 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.56 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  39.06 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.97 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12761  membrane-associated Zn-dependent protease 1  43.75 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0131503 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.61 
 
 
428 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.86 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0923796  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.68 
 
 
355 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  40.62 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  38.4 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  41.18 
 
 
452 aa  83.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.78 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  38.71 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  34.62 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.97 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  31.89 
 
 
466 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0574  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.61 
 
 
417 aa  82.4  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30609  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.88 
 
 
462 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  33.88 
 
 
462 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.71 
 
 
428 aa  82  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.71 
 
 
428 aa  82  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  36.51 
 
 
354 aa  82  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  45.26 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.14 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.59 
 
 
558 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.52 
 
 
495 aa  81.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  43.14 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.39 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_314  membrane-associated zinc metalloprotease  47.42 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.23 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.89 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  42.72 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.66 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  39.18 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.18 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.18 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  32.81 
 
 
461 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.39 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.18 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.18 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  40.98 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  32.81 
 
 
461 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  38.14 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.45 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.38 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  31.25 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  42.11 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  34.45 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  33.06 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  46.32 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.16 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  38.74 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10880  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  31.82 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.06 
 
 
457 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  33.06 
 
 
457 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.76 
 
 
456 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.06 
 
 
457 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>