More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1826 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1826  histidine kinase  100 
 
 		 828 aa  1680    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.881555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0637  histidine kinase  34.69 
 
 		 813 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01510  two-component system sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 813 aa  395  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.683286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 863 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 631 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 785 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  30.47 
 
 		 861 aa  214  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 		 1313 aa  210  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 		 896 aa  210  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 774 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  28.43 
 
 		 732 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 		 932 aa  209  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 		 643 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 846 aa  207  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 		 643 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 		 738 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  26.09 
 
 		 982 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 		 633 aa  206  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  30.5 
 
 		 651 aa  204  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 		 916 aa  204  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 		 667 aa  204  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 957 aa  203  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 767 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 995 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.97 
 
 		 1001 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  30.42 
 
 		 645 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  28.68 
 
 		 786 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 645 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0542  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 		 1302 aa  201  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  29.89 
 
 		 651 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  30.45 
 
 		 641 aa  201  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 685 aa  201  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 		 674 aa  201  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3237  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.28 
 
 		 854 aa  201  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.967707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 		 643 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 907 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 		 1002 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 643 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3752  ATP-binding region ATPase domain protein  29.13 
 
 		 825 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 		 813 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  33.5 
 
 		 896 aa  198  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 		 781 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  31.16 
 
 		 982 aa  197  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  29.66 
 
 		 641 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 765 aa  197  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 		 1326 aa  197  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 		 1363 aa  197  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  29.87 
 
 		 539 aa  197  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3474  ATP-binding region ATPase domain protein  31.93 
 
 		 706 aa  197  8.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  28.88 
 
 		 736 aa  197  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 667 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  29.71 
 
 		 952 aa  196  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 1199 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 631 aa  196  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 		 881 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 		 1064 aa  195  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  31.94 
 
 		 896 aa  195  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 925 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 		 1271 aa  195  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 950 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  31.17 
 
 		 735 aa  195  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  29.31 
 
 		 900 aa  195  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 627 aa  195  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  32.11 
 
 		 896 aa  195  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 		 952 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  30.44 
 
 		 710 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  33.01 
 
 		 896 aa  194  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.88 
 
 		 695 aa  194  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  32.11 
 
 		 896 aa  194  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 868 aa  194  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  32.11 
 
 		 896 aa  194  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 		 780 aa  194  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 		 1199 aa  194  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  32.1 
 
 		 896 aa  194  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  28.86 
 
 		 1193 aa  194  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.84 
 
 		 1059 aa  194  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  32.11 
 
 		 896 aa  193  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 743 aa  193  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 1070 aa  193  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 893 aa  193  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 1055 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 		 717 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  31.85 
 
 		 896 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  27.48 
 
 		 977 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 1310 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 1070 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0015  histidine kinase  29.2 
 
 		 868 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 		 870 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 		 1177 aa  192  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 573 aa  191  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 		 1236 aa  191  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 		 940 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 		 815 aa  191  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 1116 aa  191  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 		 896 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 		 647 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 1132 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 1002 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 1582 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 		 1771 aa  191  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>