More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0223 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0223  major facilitator transporter  100 
 
 
445 aa  858    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1055  major facilitator transporter  34.81 
 
 
433 aa  194  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.367509  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  36.27 
 
 
441 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  34.12 
 
 
468 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  36.7 
 
 
432 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  36.7 
 
 
432 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  36.7 
 
 
432 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  33.65 
 
 
446 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  32.2 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  32.2 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  32.2 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  31.75 
 
 
439 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  31.75 
 
 
439 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  32.37 
 
 
438 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  31.52 
 
 
439 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  31.35 
 
 
443 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
456 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.27 
 
 
437 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  30.84 
 
 
433 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  32.33 
 
 
445 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  30.89 
 
 
436 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  32.33 
 
 
445 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  30.5 
 
 
450 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  32.1 
 
 
460 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  32.33 
 
 
445 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  31.15 
 
 
439 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  30.86 
 
 
455 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  32.33 
 
 
445 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  31.67 
 
 
482 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  31.21 
 
 
439 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  31.21 
 
 
439 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  32.18 
 
 
439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  31.93 
 
 
463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
440 aa  166  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  30.77 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  31.64 
 
 
460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  31.87 
 
 
445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  29.23 
 
 
467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  28.04 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  30.26 
 
 
484 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  32.48 
 
 
430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 
435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  33.03 
 
 
425 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  29.31 
 
 
461 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  31.67 
 
 
469 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  29.31 
 
 
461 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  29.31 
 
 
461 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  32.25 
 
 
442 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  30.93 
 
 
427 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1014  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 
444 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.506653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  32.72 
 
 
451 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  31.05 
 
 
439 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  38.63 
 
 
450 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  30.56 
 
 
447 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  29.02 
 
 
459 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  27.84 
 
 
456 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  32.03 
 
 
433 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  30.86 
 
 
463 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  31.48 
 
 
452 aa  160  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  30.86 
 
 
463 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
453 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  30.86 
 
 
463 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  31.65 
 
 
470 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  31.4 
 
 
439 aa  160  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  31.21 
 
 
481 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  31.38 
 
 
468 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  31.88 
 
 
456 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  31.65 
 
 
470 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  31.65 
 
 
470 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  32.24 
 
 
438 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  31.42 
 
 
471 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
468 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  29.1 
 
 
443 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  31.04 
 
 
457 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  30.98 
 
 
474 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  31.04 
 
 
457 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  32.09 
 
 
470 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  31.78 
 
 
422 aa  158  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  29.98 
 
 
441 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  31.04 
 
 
457 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  30.71 
 
 
444 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  30.71 
 
 
444 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  30.71 
 
 
444 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  30.71 
 
 
444 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  30.71 
 
 
444 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
454 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  30.71 
 
 
444 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  30.71 
 
 
444 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  28.68 
 
 
458 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
442 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  29.79 
 
 
433 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  29.72 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  31.46 
 
 
430 aa  156  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  30.26 
 
 
439 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  31.46 
 
 
444 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  30.49 
 
 
440 aa  155  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  31.91 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0140  major facilitator transporter  32.21 
 
 
439 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>