More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0089 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  68.55 
 
 		 579 aa  830    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  67.32 
 
 		 573 aa  841    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  66.84 
 
 		 573 aa  837    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  68.63 
 
 		 578 aa  847    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 569 aa  1180    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  40.99 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  41.47 
 
 		 506 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  43.77 
 
 		 496 aa  410  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  43.37 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  41.26 
 
 		 487 aa  389  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  41.5 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  39.09 
 
 		 512 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  39.61 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  39.51 
 
 		 609 aa  380  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  39.68 
 
 		 495 aa  372  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  36.72 
 
 		 581 aa  360  3e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  36.35 
 
 		 582 aa  355  1e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  38.33 
 
 		 513 aa  345  1e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  35.01 
 
 		 559 aa  339  9e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  34.88 
 
 		 561 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  33.2 
 
 		 608 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 		 727 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  32.92 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  33.13 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  32.6 
 
 		 445 aa  229  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  32.11 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  31.19 
 
 		 442 aa  226  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  31.42 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 		 471 aa  223  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  30.94 
 
 		 436 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 		 467 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 		 471 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  38.02 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  30.2 
 
 		 465 aa  209  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 		 530 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 		 441 aa  203  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  28.54 
 
 		 523 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.23 
 
 		 464 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  27.22 
 
 		 776 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  28.06 
 
 		 479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  29.08 
 
 		 474 aa  180  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  26.77 
 
 		 706 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 463 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  34.62 
 
 		 588 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  27.73 
 
 		 455 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 481 aa  166  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  26.43 
 
 		 471 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 543 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  26 
 
 		 486 aa  161  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  22.53 
 
 		 514 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  22.53 
 
 		 514 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  22.53 
 
 		 514 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 533 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.42 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.66 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.23 
 
 		 329 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.84 
 
 		 336 aa  76.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.42 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.63 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.2 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.49 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.96 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.75 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.37 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.96 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.63 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.93 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25 
 
 		 327 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  26.96 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.76 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.79 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.35 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  21.29 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15625  predicted protein  25.25 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1648  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.06 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4633  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.63 
 
 		 323 aa  70.1  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0510268  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.12 
 
 		 329 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.88 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.76 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.96 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.12 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.34 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.36 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.08 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.36 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.36 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.12 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.36 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.33 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.37 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.42 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.32 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.27 
 
 		 339 aa  67  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.623593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.98 
 
 		 327 aa  66.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.491091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>