More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2345 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 148 aa  303  5.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  88.51 
 
 		 150 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0126  CBS  86.49 
 
 		 148 aa  280  6.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  86.49 
 
 		 148 aa  279  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  89.86 
 
 		 148 aa  279  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  89.19 
 
 		 148 aa  277  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  83.78 
 
 		 148 aa  266  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  52.86 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  41.94 
 
 		 199 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  43.7 
 
 		 208 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  43.7 
 
 		 204 aa  98.2  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  40.48 
 
 		 197 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  40.32 
 
 		 208 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  38.4 
 
 		 203 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  39.52 
 
 		 208 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  39.52 
 
 		 208 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0167  hypothetical protein  31.5 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3468  signal-transduction protein  38.52 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  32.77 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1829  signal transduction protein  33.88 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0766712  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1950  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.675111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  32.54 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1223  signal-transduction protein  30.95 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  34.55 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  34.13 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  29.01 
 
 		 213 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  28.87 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3476  signal-transduction protein  30.89 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1594  signal-transduction protein  32.77 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2274  signal-transduction protein  31.93 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000468461  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  37.1 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  30.23 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2759  signal-transduction protein  29.75 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  30.94 
 
 		 863 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  33.64 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  25.35 
 
 		 586 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  30.71 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  30.4 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  32 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  31.5 
 
 		 212 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  35.38 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  36.92 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.41 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  32.46 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  27.56 
 
 		 600 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  29.13 
 
 		 769 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  37.3 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  30.6 
 
 		 626 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  28.46 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  33.65 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  31.82 
 
 		 688 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 		 615 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  30.77 
 
 		 875 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  32.82 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  31.73 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.41 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.73 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 		 688 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  28.68 
 
 		 598 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.15 
 
 		 582 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  29.23 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  32.74 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  30.09 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  29.91 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  34.23 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.23 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  29.23 
 
 		 615 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 		 605 aa  55.1  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  30.65 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  31.37 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  31.93 
 
 		 626 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.61 
 
 		 606 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 		 615 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  26.5 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 615 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.57 
 
 		 603 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  25.76 
 
 		 897 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  29.46 
 
 		 907 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.57 
 
 		 603 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  29.32 
 
 		 641 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  31.54 
 
 		 324 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  31.54 
 
 		 324 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  30.09 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  32.14 
 
 		 601 aa  53.9  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  27.35 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.83 
 
 		 613 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.82 
 
 		 603 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  20.98 
 
 		 589 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  31.53 
 
 		 163 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  31.13 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  30.63 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  30.38 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  29.75 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>