More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1586 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  76.53 
 
 		 515 aa  842    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  82.24 
 
 		 501 aa  866    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  83 
 
 		 511 aa  874    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 507 aa  1048    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  80.75 
 
 		 514 aa  836    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  80.96 
 
 		 511 aa  861    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  84.42 
 
 		 509 aa  901    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  61.58 
 
 		 523 aa  630  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 583 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0741  lysyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 		 575 aa  597  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 578 aa  590  1e-167  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 563 aa  590  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 502 aa  590  1e-167  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1559  lysyl-tRNA synthetase  58.1 
 
 		 573 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 504 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4009  lysyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 571 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  56.11 
 
 		 562 aa  577  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1919  lysyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 		 567 aa  559  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 491 aa  524  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 510 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 499 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 503 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 499 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 488 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 493 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 492 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 491 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  52.01 
 
 		 491 aa  502  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 497 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 501 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 501 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 494 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 492 aa  488  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 507 aa  491  1e-137  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 494 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 494 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 492 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 508 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 499 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 499 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 499 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 499 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 503 aa  477  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 495 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 499 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 		 561 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 524 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 489 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 508 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 508 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 631 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 508 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 492 aa  465  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 573 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 508 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 508 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 508 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 502 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 505 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 577 aa  463  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 509 aa  463  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 510 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 518 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 508 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 513 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 573 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 512 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 508 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 489 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 508 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 489 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 509 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 508 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 508 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 505 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 503 aa  455  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 505 aa  458  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>