76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0996 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0996  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0974  hypothetical protein  56.54 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25980  hypothetical protein  55.71 
 
 
287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1131  hypothetical protein  52.61 
 
 
301 aa  221  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2527  hypothetical protein  44.33 
 
 
272 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000287689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1141  hypothetical protein  57.65 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.617877  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  45.1 
 
 
320 aa  195  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2807  hypothetical protein  46.86 
 
 
283 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0224369  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0633  Co/Zn/Cd efflux system component  42.45 
 
 
312 aa  188  8e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0706968  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11160  hypothetical protein  43.45 
 
 
315 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3025  hypothetical protein  45.35 
 
 
258 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144373  normal  0.932008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1090  hypothetical protein  42.91 
 
 
256 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.018463  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1170  hypothetical protein  40 
 
 
280 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3840  hypothetical protein  42.04 
 
 
284 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  41.33 
 
 
305 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3901  hypothetical protein  38.87 
 
 
293 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140637  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3460  hypothetical protein  38.32 
 
 
284 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8432  hypothetical protein  39.45 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.774825  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7951  hypothetical protein  38.04 
 
 
312 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0493  hypothetical protein  42.11 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.580154  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1845  hypothetical protein  53.24 
 
 
281 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.661954  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3850  hypothetical protein  55 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0244  hypothetical protein  46.86 
 
 
192 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5084  hypothetical protein  55 
 
 
207 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000555714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2414  hypothetical protein  55 
 
 
203 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.291745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  61.9 
 
 
200 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  61.9 
 
 
194 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3211  hypothetical protein  54.17 
 
 
193 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  54.17 
 
 
194 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1977  hypothetical protein  53.33 
 
 
194 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2319  hypothetical protein  53.33 
 
 
194 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229041  normal  0.0161406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3471  hypothetical protein  53.33 
 
 
194 aa  125  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3999  hypothetical protein  61 
 
 
194 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2042  hypothetical protein  61 
 
 
194 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4187  hypothetical protein  61 
 
 
194 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3348  hypothetical protein  52.5 
 
 
194 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.372059  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2985  hypothetical protein  60 
 
 
194 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  51.72 
 
 
379 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4566  hypothetical protein  58.59 
 
 
203 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2395  hypothetical protein  48.2 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00354329  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2543  hypothetical protein  56.19 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.578338  decreased coverage  0.00000438668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  51.54 
 
 
349 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.32 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  48.76 
 
 
1048 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  44.53 
 
 
282 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  43.8 
 
 
295 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  43.7 
 
 
387 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  44.44 
 
 
388 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  45.67 
 
 
275 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  37.88 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2152  hypothetical protein  39.66 
 
 
178 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.41449 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  40 
 
 
437 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  40 
 
 
437 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  44.23 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  50 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  41.44 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  37.41 
 
 
383 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  45.26 
 
 
514 aa  79  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.99 
 
 
554 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.34 
 
 
547 aa  73.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  33.33 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  35.14 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  36.7 
 
 
546 aa  69.7  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.26 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.46 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0028  hypothetical protein  29.95 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2808  hypothetical protein  33.96 
 
 
183 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  31.95 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4426  CHAP domain containing protein  50.7 
 
 
635 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.649059 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  27.75 
 
 
358 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  35.71 
 
 
384 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3097  hypothetical protein  31.73 
 
 
547 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.11 
 
 
386 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8932  NLP/P60 protein  38.36 
 
 
367 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00108547  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5944  hypothetical protein  30.43 
 
 
209 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5542  hypothetical protein  30.43 
 
 
209 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0579814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>