More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06520 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  100 
 
 		 311 aa  643    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  63.6 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.86 
 
 		 294 aa  202  8e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000566467  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  37.37 
 
 		 378 aa  202  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0102  membrane protease-like protein  38.93 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0649  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  38.57 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1007  band 7 protein  34.71 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226884  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03380  hypothetical protein  35.97 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1141  band 7 protein  35.05 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19805  predicted protein  36.22 
 
 		 279 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000518484  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49504  predicted protein  35.88 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000612167  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11673  predicted protein  34.26 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874367  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0050  hypothetical protein  40 
 
 		 176 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2756  band 7 protein  29.33 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  28.72 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1525  band 7/Mec-2 family protein  26.14 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  24.65 
 
 		 369 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  23.63 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.89 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1031  band 7/Mec-2 family protein  26.45 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.525956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  24.31 
 
 		 369 aa  86.3  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.75 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  26.71 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  22.46 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  24.01 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  25.6 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  25.6 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2451  band 7 protein  26.32 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0546  band 7 protein  22.65 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.57 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  25.68 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  23.66 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.32 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.32 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  26.32 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  26.62 
 
 		 427 aa  82.4  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.67 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.32 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  25.99 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  26.67 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  23.69 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  23.47 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.91 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  24.84 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  26.33 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.68 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0069  band 7 protein  25.83 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1401  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.83 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0055  hypothetical protein  37.19 
 
 		 118 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1357  protease  21.34 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.605362  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  25.61 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  25.66 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2809  band 7 protein  26.57 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.29 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  24.54 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  26.39 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  22.94 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  25.52 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  23.86 
 
 		 322 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  24.76 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0167  band 7 protein  22.76 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  22.86 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  24.67 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  25.59 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  24.52 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  26.15 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  23.68 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0321  band 7 protein  25.17 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2111  band 7 protein  23.34 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1064  band 7 protein  20.33 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  25.76 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.66 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  21.03 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.52 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  24.75 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  24.05 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0324  band 7 protein  24.48 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  21.81 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  22.54 
 
 		 439 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.71 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0057  band 7 protein  25.13 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  23.2 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  23.94 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0139  band 7 protein  25.52 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.889576  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.7 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0608  band 7 protein  25.09 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5341  band 7 protein  24.51 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207546  normal  0.117184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  23.69 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  24.49 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  24.49 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  22.54 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2454  band 7 protein  26.9 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.94 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  21.67 
 
 		 402 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  24.34 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.1 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  21.22 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  26.15 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  22.01 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  22.11 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>