More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3472 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 133 aa  280  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  58.02 
 
 		 133 aa  169  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  58.33 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  55.73 
 
 		 135 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  55.73 
 
 		 135 aa  163  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  57.69 
 
 		 133 aa  162  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  59.69 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  54.62 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  51.91 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  54.62 
 
 		 138 aa  156  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  51.15 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  55.73 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  50.38 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  53.44 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  55.28 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  51.91 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  53.49 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  50.38 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  52.67 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  52.31 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  49.22 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  53.49 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  48.36 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  54.03 
 
 		 138 aa  146  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  54.62 
 
 		 133 aa  146  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  53.08 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  55.93 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  49.62 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  50.38 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  49.23 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  54.84 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  51.54 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  51.56 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  59.26 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  49.18 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  49.62 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  52.03 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  49.59 
 
 		 139 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  50.39 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  50.42 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  53.72 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  48.84 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  53.28 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  50.89 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  44.19 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  49.59 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  43.51 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  45.04 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  51.24 
 
 		 133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  47.37 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  48.74 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  42.74 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  42.11 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  46.77 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  40.46 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  43.55 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  39.84 
 
 		 160 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  37.88 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  37.7 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  39.02 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  37.98 
 
 		 160 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  38.28 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  37.3 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  31.54 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  35.86 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  38.28 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  36.22 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  37.72 
 
 		 137 aa  85.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  33.83 
 
 		 143 aa  85.9  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  35.43 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  40.8 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  40.32 
 
 		 148 aa  84.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  35.77 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  40.52 
 
 		 159 aa  83.6  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  35.88 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  32.56 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  33.85 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  38.14 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  34.96 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  34.96 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  35.94 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  42.11 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  34.11 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  34.88 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2136  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  34.43 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  35.43 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  43.36 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2162  hypothetical protein  42.72 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  33.08 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  35.38 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  32.56 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  34.38 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  38.39 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  39.32 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  33.86 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  30.77 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>