More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1684 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  100 
 
 		 387 aa  786    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  57.11 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  48.8 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  47.06 
 
 		 382 aa  352  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  46.52 
 
 		 383 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  45.79 
 
 		 381 aa  338  8e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  45.62 
 
 		 388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  44.74 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  44.47 
 
 		 380 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 381 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  43.97 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  41.71 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  42.9 
 
 		 380 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  43.97 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  43.97 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  43.97 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  43.97 
 
 		 380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  43.97 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  43.97 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  43.97 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  43.7 
 
 		 380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  43.97 
 
 		 380 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.63 
 
 		 400 aa  302  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  40.73 
 
 		 382 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  44.27 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  42.22 
 
 		 400 aa  299  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0713  Cysteine desulfurase  40.26 
 
 		 380 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  41.01 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.96 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  42.09 
 
 		 402 aa  289  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  42.47 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  39.47 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  40.16 
 
 		 384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  39.43 
 
 		 384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  39.32 
 
 		 384 aa  286  4e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  41.82 
 
 		 382 aa  285  8e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  42.09 
 
 		 380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  42.09 
 
 		 380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  40.69 
 
 		 400 aa  282  8.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  41.45 
 
 		 386 aa  282  8.000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  39.36 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1261  Cysteine desulfurase  39.89 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0457777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  39.63 
 
 		 396 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  38.73 
 
 		 392 aa  279  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.11 
 
 		 407 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.82 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  39.31 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  41.38 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  39.58 
 
 		 391 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.1 
 
 		 396 aa  275  9e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.21 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  39.21 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0924  aminotransferase class V  39.69 
 
 		 372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281002  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  39.52 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  39.52 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  38.3 
 
 		 377 aa  272  7e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40 
 
 		 381 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.11 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  38.89 
 
 		 380 aa  268  8e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  38.83 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1373  cysteine desulphurase  39.25 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00618105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  37.8 
 
 		 414 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  38.38 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  36.22 
 
 		 388 aa  266  4e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  38.3 
 
 		 384 aa  266  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  38.87 
 
 		 398 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  39.3 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  38.87 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  39.28 
 
 		 398 aa  263  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  37.4 
 
 		 402 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  37.87 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  37.43 
 
 		 1143 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  39.68 
 
 		 380 aa  263  6e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  39.68 
 
 		 380 aa  263  6e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  36.87 
 
 		 1139 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  38.61 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  40.48 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  38.02 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  38.8 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0618  aminotransferase class V  37.62 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  39.58 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2547  Cysteine desulfurase  36.25 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  39.36 
 
 		 389 aa  260  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  39.16 
 
 		 389 aa  260  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  37.9 
 
 		 393 aa  259  4e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1224  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.84 
 
 		 384 aa  259  6e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34119  precursor of desulfurase cysteine desulfurase IscS  40.66 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  39.01 
 
 		 493 aa  258  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  40.58 
 
 		 410 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  39.39 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  38.46 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  38.62 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04685  putative NIFS-like protein  37.23 
 
 		 389 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  38.36 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0534  pyridoxal-phosphate dependent aminotransferase  38.17 
 
 		 381 aa  256  6e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  37.17 
 
 		 1135 aa  256  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  39.42 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  36.67 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  37.4 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  37.4 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>