More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0896 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 606 aa  1233    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  42.43 
 
 		 570 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  40.66 
 
 		 576 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 603 aa  259  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 602 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 633 aa  251  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 603 aa  250  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 609 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  30.54 
 
 		 564 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 		 603 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  29.83 
 
 		 1537 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 610 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.08 
 
 		 610 aa  241  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.45 
 
 		 610 aa  239  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 1538 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 1538 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 620 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 		 592 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 607 aa  233  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  30.42 
 
 		 575 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 620 aa  232  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 		 824 aa  230  5e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 610 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  27.42 
 
 		 605 aa  227  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  33.73 
 
 		 624 aa  223  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 		 562 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 1542 aa  220  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  27.85 
 
 		 1557 aa  220  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.76 
 
 		 602 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 825 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 		 610 aa  219  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 918 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 825 aa  217  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 		 605 aa  217  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 564 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 819 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 		 630 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 887 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 812 aa  211  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 		 615 aa  211  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 580 aa  211  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.88 
 
 		 597 aa  210  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 598 aa  209  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  35.1 
 
 		 824 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  30.29 
 
 		 824 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  28.37 
 
 		 811 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  28.95 
 
 		 580 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 607 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  26.41 
 
 		 616 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 604 aa  207  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  26.71 
 
 		 606 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  27.21 
 
 		 606 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.24 
 
 		 599 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 509 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  29.52 
 
 		 551 aa  205  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  27.21 
 
 		 606 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 		 633 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 612 aa  204  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 826 aa  203  7e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  25.54 
 
 		 612 aa  203  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 605 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 		 605 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 600 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  27.08 
 
 		 599 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 601 aa  200  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.18 
 
 		 614 aa  200  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 593 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 		 601 aa  198  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 		 599 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 		 903 aa  198  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 637 aa  197  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 592 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  27.63 
 
 		 679 aa  195  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  27.09 
 
 		 607 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 647 aa  193  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  30.07 
 
 		 592 aa  193  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  25.77 
 
 		 660 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 		 591 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  33.49 
 
 		 609 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1690  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 629 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00282704  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 		 609 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  24.56 
 
 		 660 aa  192  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 663 aa  192  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 591 aa  191  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 604 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  27.86 
 
 		 604 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.43 
 
 		 603 aa  190  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 592 aa  190  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 604 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  27.53 
 
 		 590 aa  189  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.09 
 
 		 598 aa  189  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 829 aa  188  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  26.71 
 
 		 595 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 594 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 		 605 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 605 aa  187  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 		 599 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  25.25 
 
 		 652 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>