More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5025 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  49.45 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  42.93 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  46.88 
 
 		 211 aa  167  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  47.09 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  46.56 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  43.63 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  45.79 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  45.3 
 
 		 211 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  39.81 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  45.65 
 
 		 260 aa  151  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  40 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  39.35 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  42.56 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  41.71 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  41.08 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  40.09 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  40.54 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  42.55 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  40 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  41.34 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  36.13 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  43.16 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  40.31 
 
 		 208 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  44.44 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  37.97 
 
 		 195 aa  128  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  41.92 
 
 		 219 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  35.45 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  37.13 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  39.04 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  38.5 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  35.29 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  36.55 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  34.92 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  34.43 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  35.68 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  41.25 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  33.69 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  43.21 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  34.65 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  36.72 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  36.76 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  38.22 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  34.74 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  40.69 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  42.31 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  38.03 
 
 		 226 aa  95.1  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 242 aa  94  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6920  methyltransferase GidB  31.61 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  37.28 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  35.88 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0693  methyltransferase GidB  31.03 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.108298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  38.31 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  38.46 
 
 		 236 aa  92.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  37.7 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  35.47 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  36.17 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  36.21 
 
 		 209 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  35.22 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  39.29 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  34.38 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  33.75 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  34.29 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  32.69 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  40.41 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  32.69 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  35.67 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  32.69 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3357  methyltransferase GidB  30.68 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  33.54 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  34.27 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07365  glucose-inhibited division protein  26.02 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0268535  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  30.85 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1749  16S rRNA methyltransferase GidB  27.93 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0466  16S rRNA methyltransferase GidB  31.4 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4081  methyltransferase GidB  29.23 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.342652  normal  0.185118 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  29.23 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  35.29 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0383  16S rRNA methyltransferase GidB  28.4 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  32.1 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  32.94 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  32.72 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  28.9 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  31.06 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  34.97 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  32.28 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1432  methyltransferase GidB  26.97 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416586  normal  0.596678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  34.87 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  33.73 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  34.19 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0895  methyltransferase GidB  29.45 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  32.76 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  32.76 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>