95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4257 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  338  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  53.15 
 
 
158 aa  149  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  35.92 
 
 
197 aa  89  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  38.46 
 
 
184 aa  89  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  33.78 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  40.18 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4474  hypothetical protein  34.46 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  34.51 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  36 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  37.63 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  35.65 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  31.67 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  35.71 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  36.17 
 
 
116 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  32.73 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  33.61 
 
 
143 aa  60.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 
157 aa  60.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  32.86 
 
 
191 aa  60.8  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  34.58 
 
 
139 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  37.38 
 
 
134 aa  58.2  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  36.36 
 
 
138 aa  57.8  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  32.65 
 
 
106 aa  57.8  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  30.84 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  33.08 
 
 
196 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  36.46 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  34.91 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  35.24 
 
 
136 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  35.24 
 
 
136 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  27.42 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  31.91 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  27.42 
 
 
223 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  28.21 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  31.68 
 
 
132 aa  53.9  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  27.42 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  31.67 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  28.71 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  28.71 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  33.58 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  27.73 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  32.41 
 
 
129 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  36.17 
 
 
122 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  33.61 
 
 
195 aa  52  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  30.48 
 
 
119 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  30.48 
 
 
119 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  27.37 
 
 
148 aa  52  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  29.52 
 
 
119 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  29.82 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  34.69 
 
 
123 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  48.5  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  48.5  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  27.27 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  32.06 
 
 
148 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  30.19 
 
 
131 aa  48.9  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  32.06 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  28.33 
 
 
133 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  27.93 
 
 
220 aa  48.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  32.97 
 
 
199 aa  47.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  33.91 
 
 
122 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  25.42 
 
 
119 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  27.55 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  25.19 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2478  hypothetical protein  27.74 
 
 
203 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  26.92 
 
 
125 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  27.55 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  30.69 
 
 
113 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  27.72 
 
 
218 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  32.04 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 
132 aa  44.7  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  44.7  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  28.44 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  33.04 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  27.78 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  27.55 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  33.04 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  29.47 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  33.04 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  29.9 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  26.42 
 
 
138 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  29.9 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  27.36 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  26.61 
 
 
133 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  29.9 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  24.73 
 
 
265 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  31 
 
 
164 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  27.05 
 
 
149 aa  42  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  33 
 
 
153 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  24.26 
 
 
152 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  26.36 
 
 
150 aa  41.2  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  25.71 
 
 
125 aa  41.2  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>