More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3015 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3015  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 429 aa  845    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  50.95 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  50.23 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  48.61 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  49.77 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  46.76 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  46.06 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  49.09 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  48.86 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  46.3 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  47.1 
 
 		 433 aa  368  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  48.02 
 
 		 444 aa  362  8e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  45.01 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  45.67 
 
 		 428 aa  358  9e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1922  homoserine dehydrogenase  48.18 
 
 		 440 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  44.32 
 
 		 441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  45.79 
 
 		 438 aa  355  6.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  43.62 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  44.52 
 
 		 436 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  45.22 
 
 		 435 aa  349  6e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  44.78 
 
 		 440 aa  349  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  44.94 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  46.14 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  45.07 
 
 		 428 aa  346  5e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  45.84 
 
 		 429 aa  346  6e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  44.71 
 
 		 428 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  44.7 
 
 		 440 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  45.85 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 		 428 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0414769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2698  homoserine dehydrogenase  45.91 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  44.77 
 
 		 440 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2966  homoserine dehydrogenase  44.83 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1647  homoserine dehydrogenase  44.01 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2495  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.35731  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 		 441 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  44.34 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 436 aa  319  7.999999999999999e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3521  homoserine dehydrogenase  45.28 
 
 		 428 aa  318  9e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.843712 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  43.25 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  43.25 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  43.18 
 
 		 439 aa  312  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  42.3 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  42.72 
 
 		 436 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  42.12 
 
 		 463 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 		 435 aa  299  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  40.7 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  41.67 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  40.71 
 
 		 439 aa  296  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  40.71 
 
 		 434 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 434 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  42.02 
 
 		 440 aa  295  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  41.81 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  38.5 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  45.11 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  40.87 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  42.06 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  42.2 
 
 		 439 aa  294  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  43.39 
 
 		 449 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 		 440 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 		 434 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  41.41 
 
 		 434 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  41.36 
 
 		 436 aa  292  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  40.47 
 
 		 448 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  39.16 
 
 		 430 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  41.11 
 
 		 444 aa  289  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  41.19 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  42.25 
 
 		 436 aa  288  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  40.89 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  40.74 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  42.75 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  43.85 
 
 		 439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  40.45 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  37.32 
 
 		 428 aa  286  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 442 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  42.38 
 
 		 433 aa  285  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  43.64 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  40.2 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  40.2 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  40.2 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  40.41 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  40.2 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  39.07 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  40.46 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  40.46 
 
 		 442 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  41.98 
 
 		 450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 		 442 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 		 442 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  38.48 
 
 		 436 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0279  homoserine dehydrogenase  40.27 
 
 		 448 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00103779  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  38.34 
 
 		 430 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>