224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2601 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2601  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  730    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  38.03 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  37.28 
 
 		 361 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  35.69 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  34.27 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  34.37 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  33.74 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0145  hypothetical protein  35.42 
 
 		 371 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0706  hypothetical protein  31.9 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  34.31 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  27.2 
 
 		 395 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  32.12 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  31.76 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  30.26 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  33.06 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4804  membrane protein-like protein  39.39 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  23.18 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  27.15 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  23.18 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  35.42 
 
 		 635 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.87 
 
 		 727 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.87 
 
 		 727 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  24.7 
 
 		 721 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.97 
 
 		 724 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.6 
 
 		 746 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  32.67 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  32.67 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  32.67 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  32.67 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.03 
 
 		 720 aa  60.1  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  27.98 
 
 		 733 aa  59.7  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  28.9 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  25.35 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  28.65 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  27.23 
 
 		 732 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  27.23 
 
 		 732 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  26.36 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.57 
 
 		 699 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  26.36 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  26.36 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  25.12 
 
 		 725 aa  56.2  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  34.72 
 
 		 217 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  26.36 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.63 
 
 		 730 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  31.17 
 
 		 700 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  40.32 
 
 		 733 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  40.32 
 
 		 733 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.08 
 
 		 746 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.43 
 
 		 727 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  24.83 
 
 		 717 aa  53.1  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  29.66 
 
 		 356 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  32.89 
 
 		 217 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  32.89 
 
 		 217 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.86 
 
 		 727 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.86 
 
 		 727 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.86 
 
 		 727 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  32.41 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.53 
 
 		 719 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  29.03 
 
 		 659 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.04 
 
 		 696 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3344  hypothetical protein  29.01 
 
 		 632 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2162  conserved hypothetical conserved membrane protein  28.99 
 
 		 679 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547772  normal  0.0766716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  28.57 
 
 		 721 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1365  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  35.35 
 
 		 744 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298227 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  40.32 
 
 		 733 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  31.72 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  31.72 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  28.57 
 
 		 720 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.03 
 
 		 679 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  23.4 
 
 		 717 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  28.97 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  27.27 
 
 		 679 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  32.26 
 
 		 711 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.7 
 
 		 695 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  31.72 
 
 		 357 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  31.72 
 
 		 357 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.38 
 
 		 706 aa  49.7  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.7 
 
 		 695 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.7 
 
 		 695 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  26.7 
 
 		 695 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  31.72 
 
 		 357 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  31.72 
 
 		 357 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  31.72 
 
 		 357 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  27.78 
 
 		 731 aa  49.7  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  26.7 
 
 		 695 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  25.71 
 
 		 727 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.38 
 
 		 706 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  41.89 
 
 		 700 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  41.89 
 
 		 696 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  41.89 
 
 		 696 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.38 
 
 		 706 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  41.89 
 
 		 700 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  41.89 
 
 		 696 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  41.89 
 
 		 696 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  41.89 
 
 		 696 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  41.89 
 
 		 696 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  41.89 
 
 		 696 aa  49.7  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  26.09 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  33.87 
 
 		 758 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>