84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1564 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  968    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  35.62 
 
 		 499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  27.36 
 
 		 593 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  27.05 
 
 		 589 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  29.06 
 
 		 610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  28.48 
 
 		 587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  29.1 
 
 		 606 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  23.53 
 
 		 641 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  22.88 
 
 		 592 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  28.45 
 
 		 589 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  27.97 
 
 		 599 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  26.04 
 
 		 578 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  27.19 
 
 		 602 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  21.65 
 
 		 581 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  25.11 
 
 		 589 aa  91.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  22.92 
 
 		 576 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  24.68 
 
 		 589 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  25.42 
 
 		 594 aa  76.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  32.68 
 
 		 247 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  23.06 
 
 		 596 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  24.8 
 
 		 574 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  26.18 
 
 		 652 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  21.08 
 
 		 565 aa  70.1  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  32.41 
 
 		 218 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  22.78 
 
 		 596 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  29.21 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  37.5 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  21.61 
 
 		 604 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  35.12 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  23.49 
 
 		 616 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  21.3 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  22.44 
 
 		 599 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  30.77 
 
 		 617 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  23.59 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  26.96 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  22.22 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  36.08 
 
 		 248 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  22.46 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  26.89 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  20.89 
 
 		 602 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  22.09 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  35.29 
 
 		 270 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  21.32 
 
 		 602 aa  53.9  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1876  hypothetical protein  28.25 
 
 		 349 aa  53.5  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  32.39 
 
 		 212 aa  53.5  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  31.58 
 
 		 273 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  20.08 
 
 		 599 aa  51.2  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  29.23 
 
 		 245 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  29.49 
 
 		 192 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0628  Rhs element Vgr protein  23.61 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  27.97 
 
 		 226 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  23.98 
 
 		 576 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  22.48 
 
 		 596 aa  47.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  22.42 
 
 		 668 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  22.71 
 
 		 615 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  27.27 
 
 		 713 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  29.29 
 
 		 702 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  29.29 
 
 		 633 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  29.29 
 
 		 633 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  29.29 
 
 		 633 aa  46.6  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  28.87 
 
 		 702 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0853  hypothetical protein  32.43 
 
 		 183 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  28.28 
 
 		 616 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1817  hypothetical protein  22.98 
 
 		 192 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1818  hypothetical protein  25.56 
 
 		 352 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  27.82 
 
 		 1057 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  35.79 
 
 		 221 aa  44.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  26.06 
 
 		 680 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  27.27 
 
 		 713 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  28.28 
 
 		 633 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  22.74 
 
 		 661 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  27.27 
 
 		 702 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  26.21 
 
 		 713 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  27 
 
 		 704 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  26.01 
 
 		 669 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  32.98 
 
 		 712 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  31.86 
 
 		 645 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  30 
 
 		 614 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  28.77 
 
 		 195 aa  43.9  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  28.77 
 
 		 195 aa  43.9  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  28.28 
 
 		 618 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  23.58 
 
 		 668 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  30.61 
 
 		 613 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  23.47 
 
 		 706 aa  43.5  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>