193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1390 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  100 
 
 
609 aa  1246    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  48.67 
 
 
605 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  45.01 
 
 
604 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  44.41 
 
 
610 aa  449  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  39.26 
 
 
614 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  38.77 
 
 
621 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  35.78 
 
 
628 aa  372  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  37.19 
 
 
635 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  37.03 
 
 
635 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  36.87 
 
 
635 aa  365  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  38.87 
 
 
630 aa  360  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  35.21 
 
 
622 aa  357  5e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  36.1 
 
 
611 aa  354  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  36.13 
 
 
607 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  36.13 
 
 
607 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  36.13 
 
 
607 aa  350  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  35.29 
 
 
608 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  35.28 
 
 
636 aa  348  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  35.48 
 
 
614 aa  345  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  35.59 
 
 
614 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  35.92 
 
 
614 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  35.42 
 
 
614 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  35.48 
 
 
617 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  37.13 
 
 
633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  33.28 
 
 
617 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  37.31 
 
 
639 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  38.28 
 
 
605 aa  318  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  33.33 
 
 
613 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  32.72 
 
 
625 aa  311  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  33.39 
 
 
615 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  33.23 
 
 
615 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  31.91 
 
 
617 aa  302  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  33.07 
 
 
615 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  31.45 
 
 
614 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  32.14 
 
 
615 aa  302  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  31.82 
 
 
613 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  31.65 
 
 
618 aa  301  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  32.01 
 
 
627 aa  299  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  32.15 
 
 
585 aa  296  8e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  31.92 
 
 
616 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  31.97 
 
 
616 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  31.76 
 
 
616 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  31.28 
 
 
602 aa  295  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  31.92 
 
 
616 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  33.17 
 
 
618 aa  294  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  33.23 
 
 
602 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  30.69 
 
 
628 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  31.92 
 
 
628 aa  282  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  32.89 
 
 
629 aa  281  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  33.56 
 
 
601 aa  280  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  33.06 
 
 
619 aa  279  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.33 
 
 
601 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  33.39 
 
 
601 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  32.2 
 
 
603 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  32.54 
 
 
603 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  32.09 
 
 
625 aa  276  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  32.2 
 
 
603 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  31.62 
 
 
603 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  33.11 
 
 
611 aa  276  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  31.86 
 
 
609 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  31.85 
 
 
601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  32.28 
 
 
609 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  36.56 
 
 
594 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  37.89 
 
 
583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  33.28 
 
 
591 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  33.16 
 
 
609 aa  273  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  32.21 
 
 
609 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  31.28 
 
 
603 aa  272  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  30.3 
 
 
624 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  32.21 
 
 
609 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  32.21 
 
 
609 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  31.76 
 
 
609 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  36.23 
 
 
599 aa  269  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  31.55 
 
 
611 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  31.14 
 
 
605 aa  266  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  35.37 
 
 
599 aa  266  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  29.2 
 
 
1283 aa  264  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  39.83 
 
 
609 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  40.59 
 
 
609 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  34.74 
 
 
619 aa  263  6.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  29.84 
 
 
610 aa  262  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  30.56 
 
 
607 aa  262  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  30.41 
 
 
616 aa  261  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  30.31 
 
 
589 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  30.86 
 
 
609 aa  259  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  29.64 
 
 
611 aa  259  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  30.65 
 
 
616 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  31.85 
 
 
588 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  31.03 
 
 
595 aa  256  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  32.5 
 
 
587 aa  256  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  30.73 
 
 
599 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  38.11 
 
 
584 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  30.81 
 
 
592 aa  250  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  30.82 
 
 
613 aa  249  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  37.95 
 
 
610 aa  249  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  31.45 
 
 
608 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  31.43 
 
 
621 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  38.44 
 
 
621 aa  241  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  31.27 
 
 
608 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  47.35 
 
 
227 aa  238  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>