More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2291 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  100 
 
 
596 aa  1206    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.95 
 
 
591 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.83 
 
 
591 aa  524  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
584 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
548 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
545 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
545 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
544 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
393 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  38.46 
 
 
392 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  33.59 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  37.21 
 
 
391 aa  134  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
658 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  34.51 
 
 
379 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  35.57 
 
 
640 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
662 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  37.56 
 
 
662 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  34.88 
 
 
381 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
564 aa  127  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
779 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  37.37 
 
 
395 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
725 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
490 aa  122  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  30.92 
 
 
391 aa  122  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  33.18 
 
 
223 aa  121  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3762  histidine kinase  34.35 
 
 
358 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011366  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  34.33 
 
 
393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  33.49 
 
 
353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  34.5 
 
 
357 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
665 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
599 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  29.41 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  36.15 
 
 
347 aa  112  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  35.82 
 
 
384 aa  111  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  28.97 
 
 
395 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 
464 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
370 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  33.64 
 
 
489 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  31.47 
 
 
1739 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  34.4 
 
 
351 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  33.74 
 
 
687 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
463 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
682 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  31.88 
 
 
373 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  34.4 
 
 
351 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.09 
 
 
482 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4910  histidine kinase  30.99 
 
 
347 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00236658  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  30.8 
 
 
515 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  33.94 
 
 
351 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  33.94 
 
 
351 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  33.94 
 
 
351 aa  107  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  33.94 
 
 
351 aa  107  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  33.94 
 
 
351 aa  107  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
610 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
771 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  33.03 
 
 
351 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  33.94 
 
 
351 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  31.95 
 
 
689 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  33.03 
 
 
351 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  33.19 
 
 
456 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
594 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
603 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
748 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
700 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
339 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  31.89 
 
 
338 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  31.9 
 
 
1046 aa  104  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
682 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
640 aa  104  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
1229 aa  103  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  25.94 
 
 
462 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  30.2 
 
 
396 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  35.71 
 
 
381 aa  103  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  32.05 
 
 
451 aa  103  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  34.09 
 
 
363 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  35.71 
 
 
381 aa  103  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
399 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  31.22 
 
 
772 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  30.5 
 
 
529 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
541 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  31.66 
 
 
497 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
359 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
552 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
381 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
332 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
535 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  34.95 
 
 
1031 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
521 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  34.56 
 
 
337 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  32.86 
 
 
710 aa  101  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
348 aa  101  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  32.86 
 
 
710 aa  101  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
770 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
346 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
595 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
421 aa  100  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  33.63 
 
 
683 aa  99.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>