More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0813 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0813  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
449 aa  927    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1127  AMP-dependent synthetase and ligase  72.71 
 
 
447 aa  674    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3967  AMP-dependent synthetase and ligase  74.05 
 
 
447 aa  685    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.923272  normal  0.0394514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4047  AMP-dependent synthetase and ligase  52.41 
 
 
447 aa  458  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3063  AMP-dependent synthetase and ligase  42.51 
 
 
446 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214783  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3791  AMP-dependent synthetase and ligase  42.06 
 
 
446 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.636512 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3895  hypothetical protein  41.85 
 
 
446 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1426  AMP-dependent synthetase and ligase  37.53 
 
 
449 aa  290  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.745476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1373  AMP-dependent synthetase and ligase  28.53 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 
505 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.17 
 
 
478 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1028  putative AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 
530 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0219794  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.08 
 
 
506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 
508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.08 
 
 
506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.08 
 
 
506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 
517 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 
553 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4529  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 
529 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 
520 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 
502 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  26.55 
 
 
511 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 
498 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 
510 aa  124  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  26.46 
 
 
520 aa  122  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 
506 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.18 
 
 
519 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 
552 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6726  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 
473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149024  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 
502 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 
502 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 
662 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.51 
 
 
507 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 
555 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 
510 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.69 
 
 
483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
508 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 
533 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 
511 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 
501 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  25.26 
 
 
511 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 
515 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.04 
 
 
490 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  27.23 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 
502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 
546 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.39 
 
 
519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  24.86 
 
 
584 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.12 
 
 
514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 
495 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  27.33 
 
 
564 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 
518 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.48 
 
 
483 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.48 
 
 
483 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 
487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.863411  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 
518 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 
521 aa  117  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3072  hypothetical protein  28.57 
 
 
448 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  25.61 
 
 
512 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  26.23 
 
 
564 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  26.87 
 
 
550 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 
525 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 
508 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.49 
 
 
523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2967  feruloyl-CoA synthetase  25.95 
 
 
515 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1574  feruloyl-CoA synthetase  25.95 
 
 
515 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4030  feruloyl-CoA synthetase  25.95 
 
 
515 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3028  feruloyl-CoA synthetase  25.95 
 
 
515 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  25.8 
 
 
492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 
508 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3956  feruloyl-CoA synthetase  25.95 
 
 
515 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3343  feruloyl-CoA synthetase  25.95 
 
 
515 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0707  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 
536 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.706357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 
518 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 
502 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 
520 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  25.87 
 
 
510 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0163  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.95 
 
 
515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 
520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 
530 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 
518 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6525  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 
487 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.57 
 
 
572 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1098  AMP-dependent synthetase and ligase  26.4 
 
 
460 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  28.53 
 
 
551 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  27.22 
 
 
565 aa  113  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  28.48 
 
 
561 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 
514 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.9 
 
 
512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  25.57 
 
 
518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  24.39 
 
 
525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0614  AMP-dependent synthetase and ligase  27.33 
 
 
502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0995  AMP-dependent synthetase and ligase  25.61 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  27.58 
 
 
577 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  24.9 
 
 
539 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  24.85 
 
 
518 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  26.54 
 
 
562 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>