More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0484 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0484  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
901 aa  1805    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0770667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
899 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
899 aa  496  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
893 aa  320  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
752 aa  187  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
885 aa  157  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
460 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
758 aa  141  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
880 aa  140  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
458 aa  140  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
489 aa  135  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  30.14 
 
 
762 aa  134  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
590 aa  132  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
608 aa  130  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
492 aa  130  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0351302  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
592 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
905 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
444 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
590 aa  128  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
610 aa  127  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
763 aa  126  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
599 aa  125  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 
911 aa  125  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
571 aa  124  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  26.09 
 
 
346 aa  124  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
701 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
590 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
581 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
604 aa  123  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
680 aa  123  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
725 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
596 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
584 aa  120  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  26.49 
 
 
581 aa  120  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
755 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
584 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
468 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 
606 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
612 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
597 aa  119  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 
815 aa  119  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0335  sensory box histidine kinase  29.12 
 
 
595 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
2153 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
597 aa  118  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
608 aa  118  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
418 aa  118  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  25.44 
 
 
581 aa  118  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  28.87 
 
 
595 aa  118  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
754 aa  118  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 
594 aa  117  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
589 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  29.2 
 
 
596 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
3470 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
612 aa  115  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
602 aa  115  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0027  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
739 aa  115  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
875 aa  115  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
396 aa  115  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
392 aa  115  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3340  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 
557 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
577 aa  114  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  27 
 
 
617 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
530 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0305  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
754 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  28 
 
 
606 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
602 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  33.91 
 
 
737 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 
600 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.78 
 
 
944 aa  112  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
763 aa  112  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 
677 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.39 
 
 
618 aa  112  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
585 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0866  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
555 aa  112  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
587 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 
700 aa  112  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  28.37 
 
 
693 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  28.11 
 
 
595 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
884 aa  111  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
726 aa  111  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.62189  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.03 
 
 
1002 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 
412 aa  110  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
620 aa  110  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
646 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
958 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 
412 aa  110  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
365 aa  109  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 
2161 aa  110  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
678 aa  110  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  30.09 
 
 
311 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 
607 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  30.57 
 
 
461 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 
591 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
591 aa  110  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
619 aa  109  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 
621 aa  108  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 
584 aa  108  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 
581 aa  108  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  30.57 
 
 
461 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>