90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1017 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  100 
 
 		 312 aa  651    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  46.58 
 
 		 312 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  43.41 
 
 		 311 aa  280  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  44.95 
 
 		 287 aa  275  9e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  42.67 
 
 		 312 aa  272  5.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  45.07 
 
 		 312 aa  266  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  43.97 
 
 		 313 aa  255  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  31.06 
 
 		 283 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  29.32 
 
 		 414 aa  109  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  26.92 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  30.85 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.64 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  25.57 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  34.67 
 
 		 272 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.33 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.79 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  24.91 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  28.04 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  26.16 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.84 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  24.84 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.22 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.92 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  24 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.76 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  25.99 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  24.61 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  24.29 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  24.59 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  30.15 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  29.06 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.65 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.71 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  28.18 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.12 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.53 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.98 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  35.54 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  29.63 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  34.71 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.71 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  33.88 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  34.71 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  24.74 
 
 		 410 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  34.71 
 
 		 213 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  33.88 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2505  putative transcription regulator protein  28.47 
 
 		 490 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0201165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.94 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.85 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  33.06 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  22.69 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.94 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2773  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 491 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.85 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.85 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.85 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  29.85 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.85 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  24.71 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1107  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 502 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.66 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  24.05 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  52.38 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  23.86 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.86 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  31.88 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  21.79 
 
 		 303 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3870  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  27.27 
 
 		 517 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  48.78 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3944  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  27.27 
 
 		 517 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445653  hitchhiker  0.00805865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  28.5 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.19 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2823  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  29.37 
 
 		 534 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.4 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  25.36 
 
 		 208 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  30.65 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3856  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  28.79 
 
 		 496 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26438  hitchhiker  0.00733732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  30.69 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2560  Ada metal-binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 581 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0738  HhH-GPD  25 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00497967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7756  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 564 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0381  HhH-GPD family protein  34.57 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0471539  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4322  alcohol dehydrogenase  22.91 
 
 		 495 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1101  Ada metal-binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 511 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.610277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.28 
 
 		 209 aa  43.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  23.4 
 
 		 207 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  26.95 
 
 		 221 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  31 
 
 		 281 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.17 
 
 		 199 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.9 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>