More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7846 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  100 
 
 		 170 aa  328  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  57.24 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  58.09 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  53.85 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  57.35 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  50.31 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  58.57 
 
 		 438 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  55.03 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  50.31 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  57.35 
 
 		 433 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  53.02 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  53.73 
 
 		 427 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  54.11 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  51.28 
 
 		 175 aa  124  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  49.69 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  51.8 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  50.68 
 
 		 203 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  45.57 
 
 		 411 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  53.44 
 
 		 432 aa  120  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  44.24 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  50.72 
 
 		 413 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  44.76 
 
 		 413 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  49.36 
 
 		 177 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  51.03 
 
 		 413 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  44.38 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  44.1 
 
 		 371 aa  115  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  43.67 
 
 		 415 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  43.95 
 
 		 186 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  48.55 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.39 
 
 		 431 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  47.74 
 
 		 432 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  41.67 
 
 		 413 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  43.88 
 
 		 416 aa  111  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  43.98 
 
 		 408 aa  110  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  60.75 
 
 		 423 aa  110  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 420 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  41.77 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  51.45 
 
 		 172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  46.15 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  45.78 
 
 		 218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  54.81 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  43.95 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  63.73 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  45.77 
 
 		 419 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  48.7 
 
 		 181 aa  107  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  64.86 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  50.68 
 
 		 173 aa  107  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  43.17 
 
 		 414 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  50 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  43.51 
 
 		 411 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  42.25 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  44.3 
 
 		 436 aa  106  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  40.52 
 
 		 415 aa  105  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  36.77 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  44.93 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  45.07 
 
 		 413 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  43.48 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  38.89 
 
 		 415 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1486  CinA domain protein  51.91 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  47.59 
 
 		 420 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  46.81 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  43.57 
 
 		 420 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  40.83 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  45.99 
 
 		 416 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  45.64 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  37.25 
 
 		 408 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  37.25 
 
 		 408 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  45.99 
 
 		 416 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1022  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  45.38 
 
 		 243 aa  101  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  49.02 
 
 		 410 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  55.86 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  52.43 
 
 		 163 aa  101  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  38.73 
 
 		 412 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  43.67 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  44.37 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  43.88 
 
 		 425 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  38.03 
 
 		 412 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  35.71 
 
 		 408 aa  99.4  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  38.03 
 
 		 412 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  40.4 
 
 		 364 aa  99.8  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  50.4 
 
 		 425 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  42.86 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  42.45 
 
 		 415 aa  99.8  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  46.9 
 
 		 417 aa  99  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  45.65 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  44.97 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  42.96 
 
 		 418 aa  98.6  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  44.97 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  44.97 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 		 413 aa  97.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  32.93 
 
 		 401 aa  97.8  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  38.03 
 
 		 412 aa  98.2  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  38.03 
 
 		 412 aa  98.2  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  38.03 
 
 		 412 aa  98.2  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  45.68 
 
 		 167 aa  98.2  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  38.03 
 
 		 412 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  51.02 
 
 		 196 aa  98.2  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  35.92 
 
 		 412 aa  97.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  38.03 
 
 		 412 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  44.03 
 
 		 417 aa  97.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>