141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7206 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 260 aa  517  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  60.61 
 
 		 136 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2099  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.33 
 
 		 136 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.85 
 
 		 134 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  48.03 
 
 		 132 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  47.54 
 
 		 135 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  46.46 
 
 		 132 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  46.22 
 
 		 133 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.73 
 
 		 135 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.27 
 
 		 131 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  49.15 
 
 		 132 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.97 
 
 		 137 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.31 
 
 		 132 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  45.59 
 
 		 135 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  46.55 
 
 		 131 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  45.3 
 
 		 387 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  44.7 
 
 		 131 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.39 
 
 		 143 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  43.08 
 
 		 131 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  43.28 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.08 
 
 		 133 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.7 
 
 		 131 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.35 
 
 		 131 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  40.71 
 
 		 141 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  42.37 
 
 		 134 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.38 
 
 		 164 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.18 
 
 		 131 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  44.62 
 
 		 131 aa  102  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  44.44 
 
 		 134 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 142 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.08 
 
 		 131 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.9 
 
 		 133 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  47.37 
 
 		 133 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  44.27 
 
 		 136 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  43.9 
 
 		 135 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 171 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.23 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.08 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.83 
 
 		 140 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.72 
 
 		 165 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.31 
 
 		 131 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  41.27 
 
 		 170 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  41.54 
 
 		 132 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2716  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.04 
 
 		 143 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  44.64 
 
 		 133 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  45.31 
 
 		 136 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  42.37 
 
 		 134 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  44 
 
 		 162 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  45.54 
 
 		 156 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  42.98 
 
 		 136 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  46.43 
 
 		 131 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  40.58 
 
 		 141 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  42.61 
 
 		 145 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  42.5 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  41.09 
 
 		 135 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 136 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.64 
 
 		 157 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  41.88 
 
 		 135 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.97 
 
 		 134 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.68 
 
 		 131 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 141 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  37.59 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24670  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  42.4 
 
 		 138 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  47.57 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  39.67 
 
 		 138 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  41.41 
 
 		 135 aa  90.5  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  43.36 
 
 		 158 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.79 
 
 		 131 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  41.86 
 
 		 157 aa  89  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  41.07 
 
 		 156 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  37.3 
 
 		 179 aa  89  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  38.33 
 
 		 164 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.36 
 
 		 131 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.52 
 
 		 158 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  40.62 
 
 		 134 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  41.07 
 
 		 156 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  41.07 
 
 		 156 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  41.32 
 
 		 135 aa  86.7  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  41.59 
 
 		 162 aa  86.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.74 
 
 		 151 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113865  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  47.19 
 
 		 153 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  38.79 
 
 		 141 aa  85.9  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.34 
 
 		 174 aa  85.5  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.37 
 
 		 398 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.68 
 
 		 158 aa  84.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  38.64 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  37.69 
 
 		 131 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001033  hypothetical protein  41.88 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.32 
 
 		 135 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.15 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.35 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  45.63 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  43.59 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  39.13 
 
 		 164 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  45.38 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  43.3 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.93 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.07 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>