More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6329 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 299 aa  598  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  45.17 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 297 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  39.4 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  40.77 
 
 		 699 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  40.7 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0121  transcriptional regulator, LysR family  38.04 
 
 		 304 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2410  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.975942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  38.02 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4032  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2730  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.118271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1385  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134108  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 283 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1726  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3818  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  35.68 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4525  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1628  putative LysR substrate binding domain  31.01 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1695  putative LysR substrate binding domain  31.01 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1636  putative LysR substrate binding domain  31.01 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1647  putative LysR substrate binding domain  31.01 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0636291  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1812  putative LysR substrate binding domain-containing protein  31.01 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01483  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.07 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2120  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01494  hypothetical protein  30.07 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2132  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1608  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2139  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487971  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1680  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1646  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2838  LysR substrate binding domain protein  31.47 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  32.82 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2972  LysR substrate binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2860  putative LysR substrate binding domain  31.47 
 
 		 314 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25895 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1612  LysR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2864  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0164886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02471  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.82 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.606343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1091  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0201845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2734  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0381749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1100  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00749087  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02435  hypothetical protein  31.82 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3814  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46170  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0324298 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2754  LysR substrate binding domain protein  31.47 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2856  LysR substrate binding domain protein  31.12 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  0.729486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  37.14 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  32.87 
 
 		 314 aa  132  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  36.23 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2391  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3926  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.07 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2004  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.079664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>