44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3179 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3179  Ricin B lectin  100 
 
 		 331 aa  672    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2834  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.36 
 
 		 166 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426204  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  29.1 
 
 		 618 aa  59.7  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.05 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  34.07 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  30.3 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  33.8 
 
 		 794 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  36.56 
 
 		 672 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.31 
 
 		 474 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  28.08 
 
 		 1016 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  28.57 
 
 		 806 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  29.1 
 
 		 771 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  31 
 
 		 806 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  31 
 
 		 806 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 806 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 806 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  31 
 
 		 806 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  31 
 
 		 806 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  31 
 
 		 806 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.78 
 
 		 507 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  27.41 
 
 		 691 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3809  NLP/P60 protein  36.08 
 
 		 496 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  27.17 
 
 		 476 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  28.24 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  29.66 
 
 		 603 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  31.78 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  40.58 
 
 		 548 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.93 
 
 		 1072 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  29.37 
 
 		 982 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  23.38 
 
 		 497 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  31.25 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  29.73 
 
 		 647 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  29.86 
 
 		 492 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  31.25 
 
 		 468 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  30.77 
 
 		 414 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  27.27 
 
 		 494 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.92 
 
 		 520 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  29.17 
 
 		 516 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  29.55 
 
 		 566 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 547 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  37.5 
 
 		 430 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  29.08 
 
 		 1567 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  29.01 
 
 		 446 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  28.03 
 
 		 558 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>