More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2102 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 340 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  57.61 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  56.85 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  56.85 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  62.43 
 
 		 337 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  54.84 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  58.94 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  57.1 
 
 		 348 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  50.62 
 
 		 338 aa  279  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.264314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1158  FAD dependent oxidoreductase  53.05 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.327107  hitchhiker  0.00150467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00520  flavin-dependent dehydrogenase  46.13 
 
 		 363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.845908  normal  0.877711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  36.75 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  44.08 
 
 		 362 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2603  monooxygenase FAD-binding  40.27 
 
 		 377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  43.03 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  41.92 
 
 		 364 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0419  monooxygenase FAD-binding  42.22 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30.52 
 
 		 418 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.12 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  29.64 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  30.56 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.31 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.41 
 
 		 398 aa  75.9  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  29.82 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.94 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  25.55 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  25 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.97 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  31.92 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.87 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  29.46 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  30.33 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 443 aa  69.3  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  30.7 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  30.57 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  31.66 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  26.83 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  31.14 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  30.63 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  31.17 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  30.77 
 
 		 423 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24.57 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  32.32 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  32.32 
 
 		 443 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  31.14 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  30.9 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  30.51 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.79 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.88 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  29.94 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.55 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  19.58 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.87 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  33.44 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  30.03 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2578  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.43 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  37.1 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  28.77 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  29.56 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  28.02 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  29.34 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  25.4 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.51 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  29.56 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  30.62 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.92 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.61 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.92 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  26.48 
 
 		 380 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  29.82 
 
 		 418 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.4 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2854  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.05 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000692604  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0093  hypothetical protein  24.61 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  27.75 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 426 aa  55.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.24 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  51.72 
 
 		 420 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3332  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.71 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0546769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3502  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.41 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.246724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  27.43 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 399 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  27.8 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  24.17 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  29.45 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0081  hypothetical protein  24.3 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1819  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  30.21 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00519293  hitchhiker  0.000000000058103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>