63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1528 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  100 
 
 
139 aa  280  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  53.73 
 
 
214 aa  124  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  53.79 
 
 
174 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  52.63 
 
 
211 aa  120  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  52.99 
 
 
164 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  49.24 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  49.24 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  48.48 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  51.56 
 
 
175 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  49.25 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  50 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  48.89 
 
 
362 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  50.38 
 
 
174 aa  107  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  54.89 
 
 
223 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  46.27 
 
 
249 aa  102  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  45.19 
 
 
191 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  46.88 
 
 
169 aa  98.6  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  43.38 
 
 
173 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.32 
 
 
219 aa  96.7  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  37.1 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  41.91 
 
 
193 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  43.61 
 
 
254 aa  94.4  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  41.38 
 
 
193 aa  94  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  44.07 
 
 
291 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  40 
 
 
331 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.54 
 
 
238 aa  84.3  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  44.62 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  37.88 
 
 
205 aa  80.5  0.000000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  46.21 
 
 
170 aa  80.1  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  37.12 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.46 
 
 
271 aa  79  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  44.36 
 
 
177 aa  77  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  39.85 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  37.93 
 
 
441 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  37.97 
 
 
383 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  37.5 
 
 
384 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  35.44 
 
 
386 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  36.25 
 
 
384 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  35.71 
 
 
498 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.18 
 
 
386 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  34.18 
 
 
386 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  34.18 
 
 
386 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  35 
 
 
386 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  34.18 
 
 
386 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  35 
 
 
386 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  34.18 
 
 
384 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  38.36 
 
 
470 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  37.66 
 
 
299 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  31.58 
 
 
299 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  40.51 
 
 
344 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  31.58 
 
 
299 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  41.11 
 
 
362 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  31.58 
 
 
299 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  31.58 
 
 
299 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  34.69 
 
 
299 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  42.25 
 
 
319 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  33.62 
 
 
289 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  41.43 
 
 
369 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  33.67 
 
 
299 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  30.77 
 
 
305 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2447  putative peptidase  28.21 
 
 
256 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  36.9 
 
 
439 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2157  peptidase, putative  28.21 
 
 
256 aa  40  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>