More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1028 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1028  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
413 aa  790    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0308  ABC transporter related protein  68.96 
 
 
401 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  61.01 
 
 
438 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5943  hypothetical protein  65.05 
 
 
425 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  59.03 
 
 
397 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0583  protein of unknown function DUF214  57.57 
 
 
403 aa  355  7.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4788  protein of unknown function DUF214  54.09 
 
 
408 aa  352  7e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123096  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4072  protein of unknown function DUF214  52 
 
 
424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000314908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0223  protein of unknown function DUF214  50.51 
 
 
422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13630  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  46.15 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.422121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27890  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.6 
 
 
495 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140819  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  32.6 
 
 
415 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 
407 aa  143  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  32.39 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  33.91 
 
 
411 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 
405 aa  139  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  28.43 
 
 
393 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.3 
 
 
437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  28.35 
 
 
397 aa  133  6e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  29.73 
 
 
403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 
406 aa  131  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  33.68 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.31 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  27.1 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  31.92 
 
 
409 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  31.92 
 
 
409 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  31.92 
 
 
409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  29.51 
 
 
391 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  30.29 
 
 
394 aa  126  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  30.89 
 
 
404 aa  126  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  32.02 
 
 
387 aa  126  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  30.87 
 
 
412 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  29.82 
 
 
405 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  28.43 
 
 
404 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  30.56 
 
 
655 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  28.43 
 
 
404 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  27.52 
 
 
394 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  29.76 
 
 
409 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 
405 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  28.89 
 
 
411 aa  122  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  28.94 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2497  protein of unknown function DUF214  29.36 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  28.43 
 
 
658 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 
403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  29.23 
 
 
405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  29.38 
 
 
401 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  30.28 
 
 
397 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8189  ABC transporter related protein  32.99 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  27.53 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  28.19 
 
 
409 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  28.19 
 
 
409 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.36 
 
 
402 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  28.94 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  25.55 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  27.69 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  27.04 
 
 
653 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  32.75 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 
410 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  31.03 
 
 
409 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  28.24 
 
 
402 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 
402 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4326  ABC transporter related protein  31.2 
 
 
391 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361609  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  29.93 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  29.93 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  30.2 
 
 
404 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  30.15 
 
 
401 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  29.65 
 
 
409 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  30.15 
 
 
401 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  29.2 
 
 
411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.8 
 
 
398 aa  116  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.25 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  26.12 
 
 
409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  28.11 
 
 
644 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 
404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  31.62 
 
 
648 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3156  protein of unknown function DUF214  32.13 
 
 
401 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  25.87 
 
 
641 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  32.24 
 
 
383 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  29.02 
 
 
707 aa  112  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1627  hypothetical protein  31.55 
 
 
425 aa  112  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  29.21 
 
 
645 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  30.5 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  28.46 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  26.88 
 
 
400 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  28.85 
 
 
412 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.97 
 
 
413 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  30.1 
 
 
397 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  32.31 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  29.87 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  29.82 
 
 
420 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  25.62 
 
 
641 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  33.2 
 
 
391 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  33.2 
 
 
391 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.81 
 
 
397 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>