50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1850 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  100 
 
 		 217 aa  433  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  38.54 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  30.38 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  27.94 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  35.37 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  34.88 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  27.52 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  33.33 
 
 		 268 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  29.87 
 
 		 268 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  34.38 
 
 		 265 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  28.11 
 
 		 256 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  25 
 
 		 336 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  40.35 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  38.89 
 
 		 342 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  35.19 
 
 		 305 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  41.67 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  32.47 
 
 		 668 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  31.88 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  35.19 
 
 		 804 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  30.12 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  30.12 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  30.12 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0451  TonB family protein  25 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  33.78 
 
 		 292 aa  45.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  35.09 
 
 		 257 aa  45.4  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  29.58 
 
 		 246 aa  45.1  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  31.15 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  32.99 
 
 		 285 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  29.51 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  37.5 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  30.26 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  29.82 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  24.24 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  26.67 
 
 		 484 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  33.87 
 
 		 583 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  28.42 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  30.77 
 
 		 447 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  31.48 
 
 		 325 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  28.12 
 
 		 276 aa  42.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  29.6 
 
 		 242 aa  42  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  29.6 
 
 		 242 aa  42  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  28.33 
 
 		 276 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  26.23 
 
 		 411 aa  42  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  31.48 
 
 		 280 aa  42  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  31.51 
 
 		 379 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  29.89 
 
 		 249 aa  41.6  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  24.72 
 
 		 386 aa  41.6  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  28.95 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  24.14 
 
 		 324 aa  41.6  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  31.25 
 
 		 274 aa  41.6  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>