216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1483 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 236 aa  480  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  55.95 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  54.67 
 
 		 224 aa  255  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  50.43 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  48.89 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  49.13 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  48.25 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  49.15 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  50.23 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  48.9 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  49.53 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  48.6 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  49.53 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  49.53 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  49.06 
 
 		 224 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  48.58 
 
 		 224 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  47.27 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  48.11 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  48.04 
 
 		 224 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  44.3 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  44.3 
 
 		 231 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  44.73 
 
 		 231 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  45.29 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  45.45 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  43.46 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  42.5 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  49.74 
 
 		 260 aa  194  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  43.16 
 
 		 231 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  49.04 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  47.76 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  49.48 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  40.83 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  44.02 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  45.83 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  43.04 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  42.13 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  42.62 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  41.87 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  40.97 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  40.53 
 
 		 221 aa  178  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  42.36 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  41.94 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  39.91 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  40.36 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  39 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  39.66 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  42.06 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  45.56 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  40.39 
 
 		 283 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  38.66 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  38.66 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  41.15 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  37.86 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  40.89 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  36.96 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  37.93 
 
 		 221 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  34.18 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  39.5 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  39.61 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  38.79 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  36.02 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  39.09 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  39.09 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  38.32 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  39.6 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  37.89 
 
 		 218 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  38.6 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  32.04 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2913  flagellar L-ring protein  41.44 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  33.48 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  32.07 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  32.67 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  33.16 
 
 		 234 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  34.74 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  32.46 
 
 		 222 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  28.99 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  32.05 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  35.09 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  32.65 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  32.37 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  30.77 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  30.14 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  33.17 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  32.37 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  30.67 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  31.44 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  28.63 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  33.52 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  31.47 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  31.82 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>