More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0771 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  100 
 
 
316 aa  658    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  72.82 
 
 
313 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  65.36 
 
 
316 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  43.41 
 
 
210 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  41.57 
 
 
181 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
182 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  47.92 
 
 
187 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  38.76 
 
 
181 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  40.11 
 
 
187 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  40.11 
 
 
187 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  40.11 
 
 
187 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  40.11 
 
 
187 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  40.11 
 
 
187 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  38.76 
 
 
181 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  43.2 
 
 
185 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  40.45 
 
 
181 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  38.46 
 
 
187 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  38.46 
 
 
187 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  38.65 
 
 
199 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  36 
 
 
182 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  42.46 
 
 
182 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  37.91 
 
 
184 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
193 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 
181 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  33.15 
 
 
181 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  40.37 
 
 
182 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 
182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  40.37 
 
 
182 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  40.99 
 
 
182 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  39.58 
 
 
184 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 
193 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 
186 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 
181 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  43.54 
 
 
190 aa  112  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 
190 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 
185 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  38.78 
 
 
180 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  35.44 
 
 
223 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  38.3 
 
 
172 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 
207 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  34.93 
 
 
199 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  34.93 
 
 
199 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  34.93 
 
 
199 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0449  hypothetical protein  38.94 
 
 
121 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  31.77 
 
 
203 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 
203 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  34.84 
 
 
198 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 
199 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 
211 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 
211 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 
203 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  33.77 
 
 
200 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 
178 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  32.43 
 
 
216 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  37.76 
 
 
190 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  34.53 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  34.53 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  35.53 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  35.97 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  34.06 
 
 
195 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  28.82 
 
 
196 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  36.3 
 
 
200 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 
196 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  34 
 
 
231 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  34 
 
 
231 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  34 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 
199 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  27.92 
 
 
359 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  31.14 
 
 
191 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 
239 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.16 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.16 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.16 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  27.92 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
234 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05268  hypothetical protein  34.82 
 
 
123 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  32.05 
 
 
206 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  33.1 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  33.1 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
199 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  28.99 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  32.88 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  27.67 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  32.41 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  28.05 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0185  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>