273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2303 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  99.77 
 
 
437 aa  839    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  100 
 
 
437 aa  841    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  53.86 
 
 
438 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  53.86 
 
 
438 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  53.16 
 
 
438 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  53.16 
 
 
438 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  53.16 
 
 
438 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  53.16 
 
 
438 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  52.22 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  52.93 
 
 
438 aa  458  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  51.4 
 
 
441 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  52.93 
 
 
493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  52.93 
 
 
438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  50.46 
 
 
494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  48.29 
 
 
439 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  48.14 
 
 
459 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  48.14 
 
 
459 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  49.53 
 
 
433 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  47.23 
 
 
442 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  44.72 
 
 
438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  45.8 
 
 
441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  46.48 
 
 
441 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  43.93 
 
 
434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  42.13 
 
 
457 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  41.55 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  42.27 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  41.59 
 
 
445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  41.14 
 
 
445 aa  335  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  41.14 
 
 
445 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  45.27 
 
 
423 aa  333  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  40.91 
 
 
445 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  41.34 
 
 
454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  44.47 
 
 
461 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  40.86 
 
 
445 aa  326  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  41.57 
 
 
472 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  40.87 
 
 
444 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  43.8 
 
 
468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  40.68 
 
 
444 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  40.96 
 
 
444 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  41.69 
 
 
455 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  40.68 
 
 
444 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  41.65 
 
 
443 aa  317  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  41.46 
 
 
444 aa  317  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  45.24 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  43.86 
 
 
458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  44.1 
 
 
455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  43.56 
 
 
437 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  41.25 
 
 
447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  40.32 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  39.19 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  41.06 
 
 
447 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  40.91 
 
 
443 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  41.12 
 
 
449 aa  298  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  39.74 
 
 
425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  40.38 
 
 
447 aa  264  2e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  38.92 
 
 
431 aa  259  5.0000000000000005e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  37.38 
 
 
462 aa  249  6e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  34.11 
 
 
431 aa  239  8e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  26.62 
 
 
473 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  27.85 
 
 
467 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  26.73 
 
 
484 aa  94.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  27.74 
 
 
466 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  24.08 
 
 
468 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0755  Na+/H+ antiporter family protein  25.69 
 
 
491 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  32.34 
 
 
507 aa  84  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  25 
 
 
483 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  24.76 
 
 
483 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 
201 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0177  Na+/H+ antiporter NhaC  25.41 
 
 
471 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  25.4 
 
 
482 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  25.76 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  31.15 
 
 
557 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  24.88 
 
 
470 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0184  Na+/H+ antiporter NhaC  23.9 
 
 
470 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0528403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0435  Na+/H+ antiporter NhaC  24.83 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00534613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0435  Na+/H+ antiporter NhaC  24.83 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  31.22 
 
 
567 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2476  Na+/H+ antiporter NhaC  31.3 
 
 
502 aa  77.8  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.629323  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4869  Na+/H+ antiporter IbeT  24.12 
 
 
467 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  31.45 
 
 
510 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0326  Na+/H+ antiporter NhaC  24.16 
 
 
473 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000241995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0310  Na+/H+ antiporter  23.77 
 
 
473 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.186537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0313  Na+/H+ antiporter  23.77 
 
 
473 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000868354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0341  Na+/H+ antiporter NhaC  24.16 
 
 
473 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0372  Na+/H+ antiporter NhaC  24.16 
 
 
473 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  24.62 
 
 
494 aa  74.7  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  29.35 
 
 
496 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  27.88 
 
 
517 aa  73.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0896  Na+/H+ antiporter NhaC  27.21 
 
 
489 aa  73.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  28.97 
 
 
513 aa  73.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  30.12 
 
 
567 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2417  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  24.55 
 
 
523 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  32.1 
 
 
524 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0736  Na+/H+ antiporter NhaC  25.11 
 
 
467 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000132088  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0614  Na+/H+ antiporter NhaC  25.65 
 
 
518 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.101313  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  23.36 
 
 
488 aa  71.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  31.29 
 
 
569 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00082  Na+/H+ antiporter NhaC  32.59 
 
 
465 aa  69.7  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0321  Na+/H+ antiporter NhaC  25.69 
 
 
473 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  24.4 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>