More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02590 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  46.03 
 
 		 1186 aa  813    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  100 
 
 		 1205 aa  2489    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81012  Mismatch repair ATPase MSH6 (MutS family)  35.16 
 
 		 1212 aa  664    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833152 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40782  predicted protein  30.33 
 
 		 1113 aa  396  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119207  normal  0.227387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  30 
 
 		 867 aa  344  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  31.01 
 
 		 859 aa  338  3.9999999999999995e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  30.22 
 
 		 870 aa  336  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  30.84 
 
 		 887 aa  336  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  30.07 
 
 		 896 aa  334  7.000000000000001e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  31.16 
 
 		 863 aa  328  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  29.74 
 
 		 828 aa  324  7e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  30.86 
 
 		 862 aa  324  8e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  30.29 
 
 		 897 aa  321  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49314  predicted protein  29.27 
 
 		 916 aa  320  9e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0725595  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  29.21 
 
 		 1091 aa  318  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  29.94 
 
 		 872 aa  318  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  28.96 
 
 		 930 aa  317  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  29.3 
 
 		 892 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 889 aa  311  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  29.07 
 
 		 869 aa  310  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  29.83 
 
 		 870 aa  310  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  29.49 
 
 		 873 aa  308  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  29.24 
 
 		 853 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  28.39 
 
 		 883 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  29.69 
 
 		 854 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  28.44 
 
 		 896 aa  305  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  28.97 
 
 		 871 aa  305  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  28.65 
 
 		 882 aa  305  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  29.38 
 
 		 868 aa  305  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  30.07 
 
 		 872 aa  304  8.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  29.63 
 
 		 851 aa  303  1e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  28.46 
 
 		 872 aa  302  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  28.46 
 
 		 858 aa  303  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  28.42 
 
 		 932 aa  302  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  28.35 
 
 		 870 aa  301  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  29.62 
 
 		 900 aa  301  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  28.29 
 
 		 856 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  29.92 
 
 		 887 aa  300  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  29 
 
 		 856 aa  300  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  28.23 
 
 		 859 aa  299  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  28.04 
 
 		 863 aa  300  2e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  28.44 
 
 		 891 aa  299  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  29.48 
 
 		 868 aa  299  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  29.51 
 
 		 840 aa  299  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  30.31 
 
 		 868 aa  298  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  28.17 
 
 		 856 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  28.29 
 
 		 804 aa  299  3e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  28.96 
 
 		 856 aa  298  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  28.9 
 
 		 865 aa  298  4e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  29.86 
 
 		 868 aa  298  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  28.72 
 
 		 880 aa  298  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  28.17 
 
 		 856 aa  297  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  30.07 
 
 		 871 aa  297  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  28.17 
 
 		 856 aa  297  9e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  29.94 
 
 		 846 aa  296  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  28.55 
 
 		 853 aa  296  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  29.19 
 
 		 855 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  28.82 
 
 		 855 aa  296  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  30.07 
 
 		 846 aa  296  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  28.9 
 
 		 882 aa  296  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  29.19 
 
 		 855 aa  296  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  29.6 
 
 		 869 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  28.62 
 
 		 881 aa  295  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  30.38 
 
 		 903 aa  295  4e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  28.98 
 
 		 854 aa  295  4e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  29.52 
 
 		 864 aa  294  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  28.27 
 
 		 871 aa  294  8e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  30.64 
 
 		 872 aa  294  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  28.06 
 
 		 861 aa  294  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  28.35 
 
 		 860 aa  293  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  29.01 
 
 		 854 aa  293  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  28.62 
 
 		 855 aa  292  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  29.51 
 
 		 910 aa  293  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  28.82 
 
 		 857 aa  293  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  27.79 
 
 		 862 aa  292  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  28.6 
 
 		 875 aa  291  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  28.54 
 
 		 853 aa  291  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  27.59 
 
 		 804 aa  291  4e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  28.82 
 
 		 927 aa  291  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59113  predicted protein  27.7 
 
 		 910 aa  291  6e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  28.8 
 
 		 820 aa  290  9e-77  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  28.48 
 
 		 968 aa  290  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  27.86 
 
 		 862 aa  290  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  28.69 
 
 		 793 aa  290  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  27.45 
 
 		 853 aa  290  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  28.96 
 
 		 878 aa  290  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  28.67 
 
 		 855 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  27.91 
 
 		 889 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  28.71 
 
 		 853 aa  288  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  29.2 
 
 		 823 aa  288  4e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  26.74 
 
 		 856 aa  288  4e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  28.62 
 
 		 886 aa  288  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  27.56 
 
 		 856 aa  288  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  27.59 
 
 		 888 aa  287  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  28.91 
 
 		 897 aa  287  9e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  28.3 
 
 		 855 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  28.69 
 
 		 851 aa  287  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  28.26 
 
 		 859 aa  287  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  28.85 
 
 		 851 aa  286  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  28.49 
 
 		 881 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>