More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01420 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK01420  threonine ammonia-lyase, putative  100 
 
 
590 aa  1215    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00537189  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  54.7 
 
 
507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83915  threonine deaminase  52.21 
 
 
539 aa  554  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370739  normal  0.0940196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  53.45 
 
 
526 aa  552  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03830  hypothetical threonine dehydratase (Eurofung)  52.4 
 
 
567 aa  545  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  52.12 
 
 
503 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  53.8 
 
 
510 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  48.9 
 
 
549 aa  531  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  52.31 
 
 
505 aa  530  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  51.63 
 
 
507 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  52.69 
 
 
503 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  51.63 
 
 
507 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  51.43 
 
 
507 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  49.34 
 
 
527 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  51.92 
 
 
506 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  50.58 
 
 
501 aa  524  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  51.92 
 
 
506 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  51.24 
 
 
507 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  51.35 
 
 
502 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  49.44 
 
 
529 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0743  threonine dehydratase  51.12 
 
 
519 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  50.29 
 
 
507 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  50.96 
 
 
504 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  48.87 
 
 
514 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0413  threonine dehydratase  51.53 
 
 
519 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  49.13 
 
 
511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  50.28 
 
 
565 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  52.77 
 
 
507 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0645  threonine dehydratase  52.2 
 
 
507 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.701109  normal  0.544724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  50.19 
 
 
515 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0354  threonine dehydratase  50.95 
 
 
565 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  49.81 
 
 
515 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  50.39 
 
 
515 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  52.19 
 
 
524 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0840  threonine dehydratase  52.39 
 
 
507 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0284  threonine dehydratase  51.61 
 
 
535 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  51.81 
 
 
524 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  51.82 
 
 
507 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  51.91 
 
 
506 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  51.82 
 
 
507 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1809  threonine dehydratase  51.23 
 
 
535 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  51.82 
 
 
507 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  51.82 
 
 
507 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  49.9 
 
 
504 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  51.04 
 
 
535 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  52.2 
 
 
535 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0679  threonine dehydratase  50.38 
 
 
520 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0606689  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4054  threonine dehydratase  51.63 
 
 
535 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0658  threonine dehydratase  50.38 
 
 
520 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0435798  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  50.58 
 
 
514 aa  506  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2766  threonine dehydratase  51.82 
 
 
507 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0370  threonine dehydratase  51.63 
 
 
507 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  49.9 
 
 
504 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0662  threonine dehydratase  51.63 
 
 
507 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  52.1 
 
 
506 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  50.48 
 
 
506 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  50.38 
 
 
517 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  49.91 
 
 
606 aa  504  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  52.01 
 
 
507 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  49.52 
 
 
503 aa  504  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  48.68 
 
 
509 aa  501  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  52.01 
 
 
507 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  49.81 
 
 
531 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  49.06 
 
 
511 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  49.06 
 
 
511 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  51.82 
 
 
507 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1900  threonine dehydratase, biosynthetic  50 
 
 
506 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  49.52 
 
 
509 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  50.47 
 
 
509 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  49.04 
 
 
507 aa  491  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  50 
 
 
514 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4909  threonine dehydratase  49.43 
 
 
527 aa  488  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  49.71 
 
 
504 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  47.17 
 
 
513 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  50.39 
 
 
509 aa  485  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1605  threonine dehydratase, biosynthetic  49.62 
 
 
506 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.677814  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  50.19 
 
 
505 aa  482  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  48.09 
 
 
520 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  48.94 
 
 
516 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  49.81 
 
 
504 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  49.53 
 
 
512 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  50.58 
 
 
510 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1311  threonine dehydratase, biosynthetic  49.42 
 
 
503 aa  478  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.484078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  49.52 
 
 
504 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  49.81 
 
 
504 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  48.88 
 
 
514 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0142  threonine dehydratase  50.19 
 
 
514 aa  475  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  49.23 
 
 
504 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  50 
 
 
550 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  49.62 
 
 
504 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  49.71 
 
 
504 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  49.62 
 
 
512 aa  475  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  49.9 
 
 
523 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0892  threonine dehydratase  47.54 
 
 
515 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  47.1 
 
 
503 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3411  threonine dehydratase  49.14 
 
 
517 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  50.96 
 
 
515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09511  threonine dehydratase  46.6 
 
 
513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.350493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  48.36 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  48.3 
 
 
516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>