118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00920 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  100 
 
 
885 aa  1745    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  49.6 
 
 
307 aa  135  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  44.8 
 
 
208 aa  117  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  44.8 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  43.55 
 
 
201 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  40.15 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  43.09 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  43.55 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  46.77 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  43.31 
 
 
212 aa  111  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  47.97 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  41.6 
 
 
203 aa  110  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  44 
 
 
214 aa  110  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  45.45 
 
 
252 aa  110  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  42.42 
 
 
213 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  41.94 
 
 
205 aa  110  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  45.74 
 
 
206 aa  109  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  41.46 
 
 
207 aa  108  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  45.6 
 
 
224 aa  108  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  43.9 
 
 
258 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  43.55 
 
 
236 aa  108  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  42.98 
 
 
205 aa  108  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  44.8 
 
 
220 aa  107  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  44.19 
 
 
205 aa  107  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  41.27 
 
 
206 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  43.2 
 
 
210 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  40.15 
 
 
211 aa  105  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  44.92 
 
 
183 aa  105  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  42.42 
 
 
207 aa  105  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  42.86 
 
 
200 aa  104  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  45.24 
 
 
215 aa  103  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  40 
 
 
212 aa  103  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  40.77 
 
 
215 aa  103  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  42.4 
 
 
203 aa  101  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  40 
 
 
202 aa  101  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  42.28 
 
 
208 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  44.92 
 
 
218 aa  99.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  42.86 
 
 
210 aa  100  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  40.58 
 
 
237 aa  96.3  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  43.7 
 
 
233 aa  95.1  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  38.71 
 
 
240 aa  93.6  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  42.4 
 
 
205 aa  93.6  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  41.18 
 
 
205 aa  90.1  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  42.19 
 
 
229 aa  87.8  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  38.46 
 
 
159 aa  87.4  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  37.12 
 
 
230 aa  85.9  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  46.67 
 
 
175 aa  83.2  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  35.2 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  34.81 
 
 
261 aa  73.9  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09072  Ras family GTPase (Rab4b), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02540)  40.91 
 
 
358 aa  73.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  35 
 
 
198 aa  73.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  30.58 
 
 
215 aa  72  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  30.58 
 
 
213 aa  72  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  33.86 
 
 
199 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  30.58 
 
 
214 aa  69.7  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  37.98 
 
 
186 aa  68.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  37.98 
 
 
186 aa  68.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  32.61 
 
 
224 aa  67.4  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  31.71 
 
 
171 aa  67.4  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  28.93 
 
 
220 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  32.03 
 
 
192 aa  67  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  24.34 
 
 
226 aa  67  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160342 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  26.67 
 
 
186 aa  66.6  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  34.17 
 
 
199 aa  65.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  32.77 
 
 
254 aa  65.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  38.2 
 
 
175 aa  65.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  39.06 
 
 
174 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  31.78 
 
 
228 aa  64.7  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  26.92 
 
 
314 aa  64.3  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  33.33 
 
 
199 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  31.62 
 
 
280 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_53175  predicted protein  42.5 
 
 
158 aa  63.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  27.34 
 
 
199 aa  62  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  36.64 
 
 
189 aa  61.6  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  34.17 
 
 
161 aa  61.6  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  29.37 
 
 
182 aa  61.2  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  32.54 
 
 
199 aa  60.1  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40171  predicted protein  24.29 
 
 
364 aa  60.1  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280697  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  29.1 
 
 
341 aa  59.7  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  31.82 
 
 
176 aa  58.9  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  28.1 
 
 
211 aa  57.8  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  26.72 
 
 
193 aa  57.8  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04782  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  38.89 
 
 
161 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.936481  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  29.1 
 
 
199 aa  57.4  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  28.8 
 
 
187 aa  56.6  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  28.57 
 
 
193 aa  55.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  32.97 
 
 
167 aa  56.2  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  28.03 
 
 
198 aa  56.2  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  31.01 
 
 
193 aa  55.5  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  29.46 
 
 
161 aa  55.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  30 
 
 
192 aa  54.7  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  28.33 
 
 
216 aa  54.7  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.2 
 
 
867 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  31.54 
 
 
179 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  30.23 
 
 
886 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  26.35 
 
 
230 aa  52.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  37.66 
 
 
178 aa  52.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  37.84 
 
 
212 aa  52  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  28 
 
 
185 aa  51.2  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  29.17 
 
 
182 aa  51.2  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>