213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03760 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND03760  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 763 aa  1544    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06870  MATE efflux family protein (Eurofung)  32.82 
 
 		 507 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00581  MATE efflux family protein (Eurofung)  33.48 
 
 		 622 aa  205  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32724  predicted protein  29.21 
 
 		 569 aa  196  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30992  ethionine resistance protein  29.67 
 
 		 589 aa  184  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.628726 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54310  predicted protein  28.12 
 
 		 606 aa  171  7e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0389645 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29306  predicted protein  26.04 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  37.57 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  34.52 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  32.34 
 
 		 458 aa  102  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  27.15 
 
 		 457 aa  98.2  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  32.27 
 
 		 458 aa  97.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  31.13 
 
 		 461 aa  97.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 470 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3441  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  33.76 
 
 		 415 aa  96.3  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  29.96 
 
 		 453 aa  95.5  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  31.05 
 
 		 452 aa  95.1  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  31.68 
 
 		 453 aa  95.1  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  30 
 
 		 457 aa  94  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  30 
 
 		 457 aa  94  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  30 
 
 		 457 aa  94  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  27.38 
 
 		 457 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  29.64 
 
 		 457 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  27.38 
 
 		 457 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  27.38 
 
 		 457 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  27.38 
 
 		 457 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27967  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  33.49 
 
 		 485 aa  92.4  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.569806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  28.23 
 
 		 457 aa  91.3  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 460 aa  90.5  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  27.38 
 
 		 457 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  25.84 
 
 		 471 aa  90.5  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  29.02 
 
 		 477 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  34.63 
 
 		 462 aa  89.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  29.02 
 
 		 477 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  30.98 
 
 		 460 aa  89.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  28.96 
 
 		 457 aa  89.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  32.43 
 
 		 425 aa  89  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  35.26 
 
 		 478 aa  88.6  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  31.34 
 
 		 453 aa  87.8  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  30.05 
 
 		 457 aa  87.4  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  29.36 
 
 		 457 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 459 aa  87  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  32.83 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  32.83 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  32.83 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  31.16 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  32.83 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  33.85 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  32.83 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  33.85 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  28.5 
 
 		 458 aa  86.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  32.94 
 
 		 462 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  26.15 
 
 		 457 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  33.85 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  32.83 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  32.35 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  32.83 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  26.15 
 
 		 457 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  30.15 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  32.35 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  32.35 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  28.36 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  32.54 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  36.36 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  33.73 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  31.86 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  32.54 
 
 		 462 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  32.11 
 
 		 454 aa  84  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  31.37 
 
 		 459 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  31.37 
 
 		 459 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  31.86 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  30.81 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  23.11 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  32.31 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_47105  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  33.92 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  28.57 
 
 		 459 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  32.21 
 
 		 463 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  29.73 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  33.33 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  28.19 
 
 		 454 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  32.97 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  33.09 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  32.97 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  32.97 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  33.09 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  32.97 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  32.97 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  27.11 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 461 aa  73.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  28.94 
 
 		 457 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35296  predicted protein  24.94 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2915  multidrug resistance protein NorM  25.83 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1006  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  27.1 
 
 		 453 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 456 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  27.1 
 
 		 453 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  31.09 
 
 		 474 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0948  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>