More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND01120 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND01120  fatty acid beta-oxidation-related protein, putative  100 
 
 		 305 aa  627  1e-179  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.2209  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03679  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_4G05870)  50.99 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  46.02 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.02 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.608035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  45.42 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 		 298 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.79 
 
 		 284 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.38 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.59 
 
 		 289 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 		 286 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259282  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.89 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.01 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.52 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.6 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.39 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 		 285 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.66 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  45.71 
 
 		 285 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.07 
 
 		 304 aa  221  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  44.88 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  44.14 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.38 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.07 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3899  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.11 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.190456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  44.52 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.37 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 285 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 		 286 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.7 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  44.17 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  44.17 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  44.17 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  44.17 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  44.52 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  44.17 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  44.17 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.29 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.93 
 
 		 285 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 		 287 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.34 
 
 		 285 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 		 285 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2292  short-chain dehydrogenase/reductase, oxidoreductase  42.4 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.253121  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.48 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752467  normal  0.0103168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 		 292 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 		 305 aa  211  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02878  oxidoreductase  45.32 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3472  oxidoreductase  45.32 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3182  oxidoreductase  45.32 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4315  oxidoreductase  45.32 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.2 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3432  oxidoreductase  45.32 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 286 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 291 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.88 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3289  oxidoreductase  44.96 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 		 285 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.1 
 
 		 288 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 		 285 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0691  oxidoreductase  44.96 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 		 285 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.09 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06640  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  44.95 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3415  oxidoreductase  44.6 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27180  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  41.7 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.66 
 
 		 282 aa  209  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 		 282 aa  209  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3411  oxidoreductase  44.96 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3405  oxidoreductase  44.96 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3506  oxidoreductase  44.96 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3331  oxidoreductase  44.96 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>