41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0515 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 401 aa  793    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  38.06 
 
 		 318 aa  225  9e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.55 
 
 		 1679 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  39.73 
 
 		 1389 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  31.08 
 
 		 631 aa  150  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  36.64 
 
 		 424 aa  146  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  40 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  36.51 
 
 		 618 aa  134  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  34.94 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  37.13 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  35.32 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  39.81 
 
 		 1059 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  29.08 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  31.3 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  30.54 
 
 		 816 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  27.55 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  33.21 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  32.26 
 
 		 479 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  27.53 
 
 		 581 aa  97.8  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  34 
 
 		 273 aa  89.4  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  28.81 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  32.7 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  26.46 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  29.56 
 
 		 581 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  28.16 
 
 		 528 aa  66.2  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  31.91 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  27.04 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  26.24 
 
 		 755 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  25.25 
 
 		 765 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  27.31 
 
 		 763 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  26.85 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0527  hypothetical protein  25.55 
 
 		 193 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.159535 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  24.65 
 
 		 1266 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  34.22 
 
 		 1041 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  25.96 
 
 		 731 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  26.33 
 
 		 755 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  26.33 
 
 		 755 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0577  hypothetical protein  40.58 
 
 		 229 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  28.57 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  27.14 
 
 		 776 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  32.04 
 
 		 1015 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>