More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0016 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  53.76 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  54.45 
 
 		 184 aa  204  7e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0083  ribonuclease HII  52.15 
 
 		 183 aa  187  5e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1971  Ribonuclease H  49.2 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0578493  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  48.6 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0280  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 188 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.259622  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0009  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  40.8 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  39.01 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  39.01 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  42.39 
 
 		 214 aa  122  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  39.27 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  38.89 
 
 		 207 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  39.27 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  38.89 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  39.01 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  38.33 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  38.33 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  38.62 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  35.48 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  38.33 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  37.78 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  34.97 
 
 		 229 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  38.33 
 
 		 208 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  37.78 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  35.91 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  34.92 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  39.56 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  36.26 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  36.11 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  36.11 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  36.11 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  38.46 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  41.4 
 
 		 245 aa  113  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  39.44 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  36.67 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  37.22 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  36.07 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  35.87 
 
 		 207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  34.43 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  37.16 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  37.16 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  37.16 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  38.62 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  37.78 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  42.35 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0045  ribonuclease HII  39.67 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  39.46 
 
 		 242 aa  111  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  35.79 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  36.07 
 
 		 248 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  34.55 
 
 		 206 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  36.22 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  39.04 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  39.89 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  36.81 
 
 		 249 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  37.23 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  36.07 
 
 		 248 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  39.46 
 
 		 308 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  36.61 
 
 		 218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  37.91 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  37.36 
 
 		 208 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  37.63 
 
 		 211 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  37.91 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  35.14 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  36.61 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  37.91 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  35.52 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  36.61 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  36.61 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  37.16 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  36.61 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  37.36 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  37.91 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  36.46 
 
 		 217 aa  107  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  35 
 
 		 198 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  35 
 
 		 198 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  34.25 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  36.41 
 
 		 191 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  36.67 
 
 		 198 aa  107  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  35 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  35 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  36.65 
 
 		 214 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  35 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  36.56 
 
 		 216 aa  107  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  35.75 
 
 		 211 aa  107  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  38.02 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  35.52 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  34.95 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  34.43 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  34.72 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  33.85 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  37.16 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  34.81 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  32.97 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  35.56 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  34.62 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  35.56 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>