65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2018 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  100 
 
 
159 aa  326  7e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  53.55 
 
 
157 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  49.68 
 
 
159 aa  170  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  42.86 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  37.89 
 
 
230 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  36.31 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  34.16 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  34.48 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  36.36 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  31.48 
 
 
185 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  39.1 
 
 
189 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  35.22 
 
 
196 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  34.19 
 
 
178 aa  100  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  33.91 
 
 
180 aa  99.4  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  35.86 
 
 
228 aa  97.8  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  34.39 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  36.31 
 
 
225 aa  94.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  34.48 
 
 
205 aa  95.1  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  34.29 
 
 
180 aa  94.7  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  34.18 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  94  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  32.26 
 
 
221 aa  93.6  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  32.26 
 
 
221 aa  93.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  35 
 
 
186 aa  92  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  32.05 
 
 
489 aa  91.7  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  30.77 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  37.78 
 
 
172 aa  91.3  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  32.28 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  34.38 
 
 
224 aa  89.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  33.99 
 
 
188 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  30 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  32.26 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.59 
 
 
428 aa  81.6  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  25.43 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  30.23 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  26.42 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  25.29 
 
 
186 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1795  flavodoxin  52.54 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000255293  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  28.79 
 
 
161 aa  58.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  31.14 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  28.57 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  26.09 
 
 
162 aa  54.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  30.65 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  24.38 
 
 
164 aa  51.2  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  25.15 
 
 
193 aa  50.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
297 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  28.3 
 
 
161 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  29.75 
 
 
157 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  26.14 
 
 
218 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  28.71 
 
 
163 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  31.34 
 
 
303 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  26.35 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  27.69 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  30.7 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  26.43 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  30.66 
 
 
191 aa  44.3  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0713  hypothetical protein  24.3 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  29.27 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  29.51 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  24.83 
 
 
163 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  27.54 
 
 
164 aa  42  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  25.83 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  23.28 
 
 
173 aa  40.4  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>