More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1238 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1238  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  266  8.999999999999999e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1981  hypothetical protein  71.76 
 
 
134 aa  192  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0851  hypothetical protein  63.78 
 
 
133 aa  156  8e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00201789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1067  hypothetical protein  58.02 
 
 
136 aa  150  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0769  hypothetical protein  58.46 
 
 
135 aa  148  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0694  hypothetical protein  57.69 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1331  hypothetical protein  56.92 
 
 
135 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0752  conserved hypothetical protein (UPF0079 domain protein)  57.81 
 
 
135 aa  143  9e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1024  protein of unknown function UPF0079  46.09 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1150  hypothetical protein  44.7 
 
 
137 aa  108  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.864213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  43.81 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  42.86 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  36.72 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  39.05 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  35.38 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  42.22 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  37.61 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00412  hypothetical protein  36.22 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  40.91 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  35.16 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  35.48 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  34.09 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  35.61 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  38.54 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  39.24 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  34.48 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  38.46 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  40.74 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  41.51 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  37.1 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  34.31 
 
 
211 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  38.14 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  39.53 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  31.62 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  33.06 
 
 
161 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  37.04 
 
 
169 aa  62.8  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  35.34 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  34.4 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  36.26 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  36.26 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  41.38 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0583  hypothetical protein  38.05 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  40.86 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  40.86 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  37.4 
 
 
540 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  30.25 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  36.73 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  36.09 
 
 
504 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  35.71 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  34.19 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  35.61 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  39.24 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  40.86 
 
 
169 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  39.58 
 
 
174 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  39.58 
 
 
174 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  33.86 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  36.59 
 
 
176 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  38.78 
 
 
143 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  31.43 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  33.65 
 
 
150 aa  59.3  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  38.71 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2816  protein of unknown function UPF0079  36.26 
 
 
192 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559153  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  36.56 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  38.46 
 
 
503 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  33 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  32.56 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  37.36 
 
 
505 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  35.79 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  33 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  42.19 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  31.25 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1453  hypothetical protein  40.96 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  37.21 
 
 
192 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  30.77 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  34.94 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  33.88 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  37.36 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17521  ATPase or kinase  44.09 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.04 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  37.04 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  38.04 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  27.86 
 
 
160 aa  57.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  32.77 
 
 
184 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0525  hypothetical protein  35.58 
 
 
177 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244934 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  35.23 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  38.46 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  36 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0824  hypothetical protein  40.48 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0786574  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  30.11 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  34.78 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  45.31 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  34.19 
 
 
167 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  40.51 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  42.22 
 
 
509 aa  57  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.23 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  34.78 
 
 
127 aa  57  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>